Аргос это: Аргос, Пелопоннес — Путеводитель | Grekomania — Транспортная компания «Гранд Атлантис»

Содержание

ООО «АРГОС» — бурение и сервисные услуги для нефтегазовой отрасли

Строительство отсыпных оснований под объекты нефтедобычи

Бурение нефтяных и газовых скважин

ТЕХНОЛОГИЯ МЕХАНИЧЕСКИХ СОЕДИНЕНИЙ «BUTLER»

Внутренее антикоррозийное покрытие нефтепромысловых труб

Подведение инфраструктуры к объектам нефтегазодобычи

Капитальный и текущий ремонт скважин

Оказание всех видов тампонажных услуг

Автотранспортные услуги

Компания сегодня

Компания «АРГОС» является одной из крупнейших сервисных компаний России, оказывающих полный спектр работ и услуг на рынке нефтегазовой отрасли страны. ООО «АРГОС» способно решать самые сложные задачи. Нашими заказчиками являются такие крупные предприятия нефтегазовой отрасли как ПАО «ЛУКОЙЛ», ПАО «НК «Роснефть», ПАО «Газпром нефть» и многие другие.

В настоящее время в состав ООО «АРГОС» входят шесть Филиалов и два Дочерних общества. Это:

Филиал ООО «АРГОС»-ЧУРС (бурение скважин, подземный ремонт скважин),
Филиал ООО «АРГОС»-КЕДР (подготовительные работы к бурению, строительство трубопроводов и полигонов твердых бытовых отходов, ликвидация и рекультивация шламовых амбаров),
Филиал ООО «АРГОС»-ПРОМЕТЕЙ (работы по обустройству кустов скважин, монтажу и капитальному ремонту нефтегазопромыслового оборудования),
Филиал ООО «АРГОС»-СУМР (тампонажные работы, транспортные услуги и услуги спецтехникой),
Филиал ООО «АРГОС»-СПЕЦТРУБОПРОВОДСТРОЙ (строительство промысловых трубопроводов).
Филиал ООО «АРГОС»-БУРЕНИЕ (бурение боковых стволов, бурение эксплуатационных скважин, бурение поисково-разведочных скважин).

Дочерние общества:

ООО «Лангепасско-Покачевское управление ремонта скважин» (работы по капитальному и текущему ремонту скважин),
ООО «ЛАНКОР» (производство по внутреннему антикоррозийному покрытию и подготовке под стык «BUTLER» трубной продукции).

Основное конкурентное преимущество Компании — опытный и высококвалифицированный персонал, наличие производственных мощностей и баз, позволяющих быстро и эффективно выполнять работы на объектах заказчиков в Ханты-Мансийском, Ямало-Ненецком автономных округах, Пермском крае и других субъектах Российской Федерации. География деятельности ООО «АРГОС» и его Дочерних обществ обширна и продолжает расширяться.

ООО «АРГОС» успешно осуществляет свою производственную деятельность с совершенствованием технологий в соответствии с требованиями нефтедобывающих компаний, направленных на интенсификацию добычи нефти, повышение качества работ, минимизацию затрат и сроков выполнения заказов, при строгом выполнении требований техники безопасности и соблюдением экологических стандартов.

Стратегия компании

Стратегия ООО «АРГОС» направлена на эффективное выполнение полного комплекса сервисных услуг при строительстве нефтяных и газовых скважин.

Реализуя стратегию компании мы:

Постоянно повышаем качество оказываемых услуг за счет использования современного оборудования и повышения квалификации сотрудников компании.

Расширяем географию деятельности и диверсифицируем производство за счет накопленного регионального опыта и усиления производственных мощностей.

Стремимся к достижению долгосрочных партнерских отношений за счет высокого уровня производственной культуры, надежности и профессионализма.

Повышаем эффективность за счет централизованного планирования производственной деятельности и оптимального использования материальных и трудовых ресурсов.

Повышаем социальную ответственность за счет обеспечения социальных гарантий сотрудникам и социально ответственного участия компании в жизни общества.

География деятельности

Филиал ООО «АРГОС»-ЧУРС

Филиал ООО «АРГОС»-БУРЕНИЕ

Филиал ООО «АРГОС»-КЕДР

Филиал ООО «АРГОС»-ПРОМЕТЕЙ

Филиал ООО «АРГОС»-СПЕЦТРУБОПРОВОДСТРОЙ

Филиал ООО «АРГОС»-СУМР

ООО «ЛАНГЕПАССКО-ПОКАЧЕВCКОЕ УПРАВЛЕНИЕ РЕМОНТА СКВАЖИН»

ООО «ЛАНКОР»

Уникальный почерк мастеров компании ООО «АРГОС»

Чествуем уникальных людей, преданных своему делу, верных Компании и посвятивших более 25 лет выбранному пути.
Выражаем признание и благодарность за многолетний труд и значительный вклад работников в успешную работу и развитие Компании.

➤

15 лет ООО «АРГОС» — Искусство быть надежным!

В 2020 году Компания «АРГОС» празднует свой 15-летний Юбилей! В преддверии 15 летнего Юбилея Компании «АРГОС» наша большая команда профессионалов, состоящая из 6 Филиалов и 3 Дочерних обществ, представляем вам фильм о работе Компании «АРГОС»!

➤

День Победы!

Победа в Великой Отечественной войне – героический подвиг народа.

День Победы мы отмечаем как главный праздник страны. Коллектив ООО «АРГОС»-СУМР подготовил видео-поздравление к 75-ти летию Дня Победы!

➤

Обзор деятельности Филиала ООО «АРГОС»-БУРЕНИЕ

В Филиале ООО «АРГОС»-БУРЕНИЕ бригада №102 ЭиРБС приступила к бурению поисковой скважины на месторождении Лангепасского региона Общества «ЛУКОЙЛ-Западная Сибирь».

➤

Время оценить перспективы!

Первый юбилей — важное событие, устанавливающее в истории предприятия особую веху. И в Филиале ООО «АРГОС»-«СпецТрубоПроводСтрой» в эти дни подводят итоги и намечают новые масштабные цели.

➤

Проект «Сила Поколений». Первоклассники

В 2019 году стартовал новый корпоративный проект с символическим названием «Сила поколений»

➤

Наши заказчики

10 лучших отелей в городе Аргос, Греция (от € 50)

Количество звезд

5 звезд 4 звезды 3 звезды 2 звезды 1 звезда

Оценка по отзывам

Превосходно: 9+ Очень хорошо: 8+ Хорошо: 7+ Достаточно хорошо: 6+

Наши рекомендации Самая низкая цена в начале Количество звезд и цена Оценка + кол-во отзывов

Morfeas Hotel

2 звезд

org/PostalAddress»> Отель в городе Аргос

Отель Morfeas расположен в историческом центре города Аргос. К услугам гостей номера с балконом и видом на площадь Святого Петра или пешеходную зону. Morfeas hotel was nice, even though we were there just for 1 night. Everything went as expected. The room was renewed with a nice bath and a bedroom with a balcony. Directly in the city center of Argos. A bit issue with parking, but we found a place near to the hotel.

Развернуть Свернуть

Очень хорошо

672 отзывов

Цена от

€ 33,50

за ночь

Проверить наличие мест

Apollon Hotel

1 звезд

Отель в городе Аргос

Отель Apollon расположен в центре города Аргос на полуострове Пелопоннес и предлагает гостям номера с кондиционером и с балконом с видом на окрестности. Lovely small hotel, one star only but felt better than 3 stars Very fresh bathroom, a lot of small thoughtful things in it Comfy room Friendly stuff (the most friendly among six hotels we’ve stayed in other Greece cities) We have asked for one more small pillow and got it immediately

Развернуть Свернуть

8. 8

Потрясающе

92 отзывов

Цена от

€ 50,50

за ночь

Проверить наличие мест

Palladion Boutique Hotel

3 звезд

Отель в городе Аргос

Бутик-отель Palladion расположен на центральной площади города Аргос. К услугам гостей индивидуально оформленные номера с балконом, а также массаж, турецкая баня и бесплатный Wi-Fi на всей территории…. Exceptionally friendly and helpful staff. We were also very pleasantly surprised to have been allocated reserved parking. The room was of the highest standard and the location perfect. We recommend it without hesitation!

Развернуть Свернуть

8.6

Потрясающе

145 отзывов

Цена от

€ 53,50

за ночь

Проверить наличие мест

Hotel Mycenae

2 звезд

org/PostalAddress»> Отель в городе Аргос

Hotel Mycenae is situated in Argos, 2.7 km from Larissa Castle and 8.2 km from Elliniko Pyramid. I liked the location very central close to everything friendly and helpful staff.

Развернуть Свернуть

7.6

Хорошо

161 отзывов

Цена от

€ 33,50

за ночь

Проверить наличие мест

Central flat in Argos with a view on Nafplio

Аргос

Апартаменты Central flat in Argos with a view on Nafplio расположены в городе Аргос, в 1 км от культурного центра Megaro Trikoupi. К услугам гостей общий лаундж, бесплатный Wi-Fi и общая кухня. directly in center of Argos and still very quiet and peaceful

Развернуть Свернуть

Превосходно

25 отзывов

Цена от

€ 50

за ночь

Проверить наличие мест

Paraskevi’s House

org/PostalAddress»> Аргос

Апартаменты Paraskevi’s House с видом на город расположены в 500 м от Античного театра в городе Аргос. К услугам гостей балкон и чайник. К услугам гостей терраса и бесплатный Wi-Fi на всей территории…. The apartment is big, cozy, clean and comfortable. The owner is so kind, she made a cake for us. I totally recommend the place, is 15min by car to Nafplio.

Развернуть Свернуть

9.4

Превосходно

44 отзывов

Цена от

€ 50

за ночь

Проверить наличие мест

Urban comfortable apartment

Аргос

Апартаменты Urban comfortable расположены в городе Аргос, в 200 м от культурного центра Мегаро-Трикупи и в 700 м от Античного театра Аргоса. The location is perfect in the center of Argos and easy to find parking space. All facilities you may need are in the apartment. Friendly host, wo gave clear directions. Apartment is spacious, you could even stay with 4 people

Развернуть Свернуть

9. 3

Превосходно

17 отзывов

Цена от

€ 51,84

за ночь

Проверить наличие мест

ΘΕΑ στο ΝΑΥΠΛΙΟ

Аргос

Set in Argos, 800 metres from Elliniko Pyramid and 7.9 km from Ancient Theatre of Argos, ΘΕΑ στο ΝΑΥΠΛΙΟ offers a garden and air conditioning.

Развернуть Свернуть

Оценка по отзывам

1 отзывов

Цена от

€ 60

за ночь

Проверить наличие мест

Arcadia Spirit

Аргос

Set in Argos, 800 metres from Train station of Argos and 1 km from Akropolis of Aspida, Arcadia Spirit offers air conditioning.

Развернуть Свернуть

Хорошо

1 отзывов

Цена от

€ 56

за ночь

Проверить наличие мест

Villa Ero

org/PostalAddress»> Аргос

Boasting an outdoor swimming pool, a bar, and a garden, Villa Ero features accommodation in Argos with free WiFi and pool views. This property offers a private pool and free private parking.

Развернуть Свернуть

Великолепно

2 отзывов

Цена от

€ 296,80

за ночь

Проверить наличие мест

Посмотреть 6 отелей в городе Аргос

Аргос и аргосская коалиция в период Никиева мира Текст научной статьи по специальности «История и археология»

УДК 94 (38) «-5»

АРГОС И АРГОССКАЯ КОАЛИЦИЯ В ПЕРИОД НИКИЕВА МИРА

Делается анализ ситуации, сложившейся после заключения Афинами и Спартой Никиева мира; возможностей, позволивших Аргосу создавать свою независимую коалицию государств; а также обстоятельств, приведших к неудаче этого предприятия и к утрате Аргосом лидирующей роли. Политику Аргоса в рассматриваемый период, как и в более раннее время, следует характеризовать как исключительно про-аргосскую, основанную на прагматическом расчете, поиске путей, дающим возможность занимать ведущее место в жизни Греции.

Ключевые слова: Аргос, Афины, Коринф, Лакедемон, Спарта, Ни-киев мир, полис, союз.

Как сообщает Фукидид (У.14), ко времени окончания срока действия 30летнего мира, аргивяне не пожелали заключить новый мирный договор со спартанцами, если те не возвратят им область Кинурию. Это решение, ставящее Спарту в весьма трудное положение, недвусмысленно демонстрирует желание Аргоса отказаться от политики нейтралитета.

Трудно не согласиться с Т. Келли, что время принятия этого решения вызывает некоторое недоумение1. Лакедемоняне только что продемонстрировали свою силу, одержав над афинянами две победы подряд — при Делии и под Амфиполем (ТИис. У.14). Несомненно, что Аргосом был упущен ряд значительно более благоприятных моментов с военной точки зрения. Кроме того, Фукидид (У.14) дает понять, что как со стороны Спарты, так и со стороны Афин преобладали мирные настроения. Однако, как справедливо полагает Келли, выбор момента оказался весьма удачен с дипломатической точки зрения. Аргивяне не могли не знать о мирных переговорах, проводимых Афинами и Спартой. Они не могли не понимать, что далеко не все союзники Спарты поддерживают эти мирные настроения. Как сообщает Фукидид (У.17) против заключения мира выступили беотийцы, коринфяне, элейцы и мегарцы. С другой стороны, аргивяне осознавали, что отказ от возобновления мирного договора послужит дополнительным стимулом к заключению Спартой мира с Афинами. Фукидид (У.14) объясняет, что лакедемоняне считали невозможным воевать одновременно с аргивянами и афинянами.

Впрочем, не имеющий союзников Аргос вряд ли именно в этот момент рассматривал возможность начала военных действий. После заключения Никиева мира в 421 г. до н.э. ситуация выглядела так, как если бы Спарта дезертировала, оставив своих союзников, которые остались фактически проигравшими по результатам войны. Очевидно, это было как раз то, что ожидал Аргос, и то, чего не исключала сама Спарта (ТИис. У.14).

Вскоре после заключения Никиева мира Спартой было направлено посольство в Аргос для ведения мирных переговоров, которые, как и незадолго до этого, не увенчались успехом2. Однако, такое положение давало возможность лакедемонянам говорить о вынужденности союза с Афинами, оправдывать его опасениями, что, если бы они, спартанцы, не заключили этот союз первыми, то это могли бы сделать аргивяне, и пытаться тем самым склонить возникшую оппозицию к принятию условий Никиева мира.

Но расчет аргивян оказался более точным. Альянс Спарты с Афинами настолько отдалил от нее Коринф, что, как только военный договор был подписан, ко-

1 Kelly Th. Argive Foreign Policy in the Fifth Century B.C. // Classical Philology. 1975. Vol. 69. №2. P. 90f.

2 Т. Келли подчеркивает поспешность, с которой лакедемонянами были направлены в Аргос послы. Это, по мнению исследователя, свидетельствует о том, что Спарта не рассчитывала на положительный исход переговоров. Kelly Th. Op. cit. P. 91.

А. В. УНЖАКОВ

Нижегородский

государственный

лингвистический

университет

им. Н.А. Добролюбова

e-mail: [email protected]

ринфские послы направились из Лакедемона (куда они были приглашены на собрание) в Аргос, где они вступили в переговоры с некоторыми аргосскими должностными лицами. Они объявили аргивянам, что лакедемоняне заключили мир и союз с афинянами не с добрыми намерениями, а с целью поработить весь Пелопоннес. В то же время Аргосу было предложено возглавить коалицию пелопоннесцев. По мнению коринфян, Аргос должен был обратиться ко всем независимым эллинским городам с предложением вступить в оборонительный союз (ТИис. У.27)3. Одновременно с этим наиболее влиятельные города обменивались между собой посольствами и обсуждали все, что касалось единства действий и союза против афинян и лакедемонян (РюЬ. XI1.75.3).

Безусловно, в приведенной ситуации и многих последующих Коринф, преследуя собственные цели, играл значительную роль в формировании отношений между государствами Пелопоннеса. Однако представляется, что роль единоличного лидера в дипломатии, которую Дж. Салмон зачастую отводит коринфянам, является несколько завышенной4. При этом мы никак не отрицаем высокую степень влияния Коринфа, как одного из крупнейших и сильнейших полисов Греции, на формирование политических отношений. .50.5) о том, что после Олимпийских игр, проводимых летом 420 г. до н.э., аргивяне с союзниками пытались склонить коринфян присоединиться к их союзу, Уэстлейк делает вывод, что аргивяне были полностью введены в заблуждение коринфской дипломатией и никогда не понимали реальных мотивов Коринфа5. Нам представляется более правомерным аргумент Т. Келли, что в данной ситуации аргивяне имели все основания полагать, что коринфяне могут пожелать выйти из Пелопоннесской лиги после того, как лакедемоняне были подвергнуты унижениям во время Олимпиады (ТИис. У.50.1-4)6.

Добившись своей цели по разъединению Спарты и ее союзников, Аргос должен был действовать быстро и решительно, поскольку иначе Коринфу ничего не оставалось делать, кроме как снова пойти на сближение с лакедемонянами и принять условия Никиева мира. Кроме того, лакедемоняне, будучи свидетелями объединения против них Пелопоннеса, старались укрепить свои позиции, пытаясь добиться расположения союзников, настроенных враждебно против них (РюЬ. XI 1.76.1-2).

Незадолго до этих событий, в 426 г. до н.э., Аргосом было отклонено предложение Клеона о союзе с Афинами, что не может не свидетельствовать о том, что внешняя политика Аргоса не была ориентирована на дружбу с Афинами и вражду со Спартой. Несомненно, политика аргивян была анти-спартанской, однако, в то же самое время она не была про-афинской. Аргос не мог не осознавать, что ни один из его потенциальных союзников не питал каких-либо симпатий по отношению к Афинам. Одни были противниками Спарты (Элида, Мантинея), другие — противниками Афин (Беотия, Мегары и халкидяне), третьи — противниками Спарты и Афин (Коринф). Такая ситуация исключала какую-либо возможность сближения Аргоса с Афинами. В целом, создавшееся положение было уникальным. Незапятнанный какими-либо отношениями ни с одной из воюющих сторон и заслуживший твердую репутацию третьей стороны Аргос намеревался приступить к использованию этого политического капитала.

Однако Аргосу не было суждено в полной мере реализовать свои намерения. По-видимому, слишком многие из потенциальных союзников преследовали исключительно личные цели, которые могли носить порой противоречивый характер. Очевидно, что целью мантинейцев и элейцев было воспрепятствование Спарте, поку-

3 Х. Уэстлейк обращает внимание на проворство, с которым коринфяне приступили к ведению переговоров, что, по мнению исследователя, свидетельствует о том, что план действий возник еще до заключения союза между Афинами и Спартой. Westlake H.D. Corinth and the Argive Coalition // American Journal of Archaeology. 1940. Vol. 61. P. 414f.

4 Salmon J.B. Wealthy Corinth. A History of the City to 338 B.C. Oxford, 1984. P. 324-341.

5 Westlake H. D. Op. cit. P. 418.

6 Kelly Th. Op. cit. P. 96.

шавшейся на их интересы — подчиненную мантинейцами часть Аркадии и подконтрольный элейцам город Лепрей в южной части Элиды (ТИис. У.29.1; 31.2-5). Основной целью коринфян и халкидян было возобновление войны с Афинами. Беотийцы и мегарцы вообще не спешили вступать в союз по причине недоверия демократическому правительству Аргоса (ТИис. У.31.6). Тегейцы же, воевавшие незадолго до этого с мантинейцами при Лаодокии в Оресфиде (ТИис. IV.134.1X скорее всего, не были расположены состоять с последними в одном и том же союзе. После того, как эти три полиса отказались вступить в лигу, энтузиазм Аргоса заметно угас. По всей вероятности, анти-спартанские настроения оказались не настолько сильны, как это было представлено коринфянами. Кроме того, действия самих коринфян не могли не вызывать определенную озабоченность. Когда аргивяне, элейцы и мантинейцы заключили оборонительно-наступательный союз, коринфяне не присоединились к договору, заявив, что достаточно оборонительного союза для взаимной помощи, а нападать они ни на кого не желают (ТИис. У.48.2-3).

По всей вероятности амбиции Коринфа несколько отличались от тех заверений, которые были даны аргивянам. Возможно, планы коринфян не ограничивались возобновлением Пелопоннесской войны с заменой Спарты Аргосом в качестве формального лидера, а содержали пункт о включении Спарты в Аргосскую Лигу или, скорее, принуждении войти в нее при благоприятном исходе.

Действительно, в случае присоединения к Аргосской Лиге Беотии, Мегар и имеющей стратегически важное положение Тегеи Спарта могла оказаться в изоляции, что могло нейтрализовать ее в случае начала военной операции против ее аттического союзника или, желательно, подтолкнуть к разрыву союзных отношений с Афинами с последующим вхождением в Аргосскую лигу. А, как известно, вариант расширения Аргосского союза за счет Спарты и/или Афин, хотя и имел особую процедуру — не через 12 уполномоченных, а через народное собрание аргивян — полностью не исключался условиями (предложенными корифскими послами), одобренными Аргосом (ТИис. У.28.1). Также вероятно, что коринфяне заняли выжидательную позицию, надеясь на разрыв между афинянами и лакедемонянами, между которыми уже возникали трения, и с течением времени формировалась атмосфера подозрений (ТИис. V.25.1-2). В сложившейся ситуации коринфяне не могли не осознавать, что любые военные действия, которые могут начаться, будут направлены против Спарты, что не могло соответствовать их планам.

Таким образом, к весне 420 г. н.э. деятельность аргивян по созданию независимой лиги греческих государств зашла в тупик. Пришло время задуматься о путях выхода из создавшегося положения. Вероятнее всего, рассматривалась возможность возобновления нейтралитета и возможность союза с одним из лидирующих государств. Аргивяне выбрали второе. При этом, как это ни странно, предпочтение народного собрания было отдано Спарте. Причиной этому могла послужить нераспо-ложенность аргивян к афинянам. Возможно, впрочем, что ситуация была сложнее.

Некоторые исследователи склонны рассматривать аргивян либо как олигархов, поддерживающих близкие отношения со Спартой, либо как демократов, которые по определению должны были быть настроены на установление союза с демократическими Афинами7. Нет оснований полагать, что все политические решения находили единогласное одобрение среди аргосского демоса (ТИис. У.76.2). Хотя из повествования Фукидида можно заключить, что сторонники олигархии вплоть до 418 г. до н.э. не предпринимали явных попыток подчинить себе правительство, кажется очевидным, что именно этими сторонниками осуществлялась пропаганда политики сближения со Спартой.

В конце зимы или начале весны 420 г. до н.э. в нарушение условий Никиева мира лакедемоняне заключили союз с беотийцами по настоянию последних. Сразу

7 Schwarz E. Das Geschichtswerk des Thukydides. Bonn, 1919. P. 66-71; Busolt G. Forschungen zur Griechischen Geschichte. Breslau, 1880. P. 75-181.

после заключения союза беотийцы принялись за разрушение Панакта (ТЬис. V.39.3). Аргивяне каким-то образом были поставлены в известность о происшедших событиях. При этом все было представлено так, как будто бы лакедемоняне уговорили беотийцев присоединиться к мирному договору с афинянами. Аргивяне боялись, что столкнутся в лице Спарты, Афин, Беотии и Тегеи с объединением более сильным, чем их собственная лига. Единственным выходом, остававшимся для Аргоса в данной ситуации было немедленное заключение союза с Лакедемоном. С этой целью аргивянами были направлены послы, которые считались самыми близкими друзьями лакедемонян (ТЬис. V.40.1-3). Только когда послы уже прибыли в Спарту, аргивяне узнали о настоящем положении дел. После того, как известие о разрушении Панакта и заключении союза между спартанцами и беотийцами достигло Афин, Алкивиад тотчас послал от себя лично в Аргос вестника с предложением немедленно прибыть вместе с представителями Мантинеи и Элиды в Афины и привлечь афинян к союзу, которому он готов всемерно содействовать (ТЬис. V.43.3)8. Даже не ставя в известность своих послов в Спарте, аргивяне с мантинейцами и элейцами приняли решение войти в союз с афинянами (ТЪис. V.44.2).

Аргосским послам тем временем не удалось добиться каких-либо уступок со стороны лакедемонян по Кинурии. Очевидно, Клеобул и Ксенар оказались в меньшинстве: трое других эфоров, по-видимому, не имели заинтересованности в заключении союза с Аргосом. Аргивянам было предложено возобновить договор 451 г. на прежних условиях. Аргосские послы выдвинули встречное предложение — заключить 50-летний мир, но при этом стороны оставляют за собой право решить спор о Кину-рии оружием. Сначала лакедемоняне посчитали услышанное, но затем согласились принять это при условии, что проект договора еще до его вступления в силу должен быть одобрен народным собранием (ТИис. У.41.2-3). Разумеется, вероятность победы аргосской армии над спартанской была весьма призрачной, и этот договор мог дать лакедемонянам возможность решить вопрос Кинурии в свою пользу и на долгое время. Уступчивость аргосских послов свидетельствовала лишь об их личной заинтересованности в сближении со Спартой.

Таким образом, заключая союз с афинянами, аргивяне выбирали меньшее из двух зол — действовали не из личных симпатий к Афинам, а стремились сохранить действующее демократическое правительство. Они оказывали содействие в воспрепятствовании участию лакедемонян в Олимпийских играх 420 г., а в следующем году по совету Алкивиада начали войну против Эпидавра9. Как сообщает Фукидид (У.53), вторжение было вызвано решением любыми средствами заставить эпидаврейцев присоединиться к их союзу, чтобы обеспечить нейтралитет Коринфа и дать возможность афинянам переправлять свое войско кратчайшим путем из Эгины. Однако очевидно и то, что причиной, по всей вероятности, основной, послужило желание спровоцировать Спарту на начало военных действий, поскольку спартанцы не могли не прийти на защиту своего союзника по Пелопоннесскому союзу.

Осада Эпидавра не принесла положительных результатов для Аргоса. Неудачей, по мнению аргивян, окончилось и противостояние с Лакедемоном на аргосской равнине по причине заключения перемирия на 4 месяца без ведома самих аргивян и их союзников. Фрасил, один из пяти стратегов и сторонник сближения со Спартой, по собственному почину прямо перед началом битвы обратился к Агису, царю лакедемонян, и уговорил его не давать сражения, обещая уладить все разногласия10. По всей

8 Подобным образом описывает события Плутарх (Plut. Alcib. 14). В отличие от Фукидида и Плутарха, по версии Диодора, инициатива заключения союза с Афинами исходила от Аргоса (Diod. XII .77.3).

9 Диодором не упоминается в этой связи Эпидавр. По его версии, не имеющей аналогий, Аргосом был опустошен Трезен (Diod. XI1.78.2). Возможно, источник Диодора, Эфор, опирался в данном случае на какие-то другие сведения.

10 Принимая во внимание положение аргивян с союзниками перед этой несостоявшейся битвой, описанное Фукидидом (V.59.3), аргивяне не имели каких-либо шансов на успех. Критикуя ошибки аргосских военачальников, занявших со своей армией очень невыгодную позицию, Л. Лосада (вслед за Д. Каганом) объясняет их нежеланием аргосских военачальников — «пятой колонны» — воевать против

видимости, Фрасил привел достаточно веский и аргумент, который смог убедить Аги-са, занимавшего со своей армией выгоднейшую позицию (ТИис. V.59.з), не разбивать аргивян. Таким аргументом могла быть гарантия того, что Аргос готов войти в союз со Спартой. Это в свою очередь, как полагает Д. Каган, свидетельствует об усилившемся положении аргосских олигархов11.

Перемирие не вызвало радости ни со стороны спартанцев, ни со стороны аргивян. Фрасилу едва удалось спастись, когда на обратном пути в Аргос аргивяне стали побивать военачальников камнями (ТИис. V.60.5-6; йюЬ. ХМ.78.5). Но, несмотря на недовольство перемирием, аргивяне не спешили разрывать договор с лакедемонянами. Это может показаться странным, но, по-видимому, действия афинян начали вызывать серьезные подозрения в Аргосе. Ведь, втянув аргивян в конфронтацию со Спартой, сами афиняне не пришли вовремя на помощь своим союзникам. И, когда афинские подкрепления наконец-то прибыли (в Аргос), аргивяне попросили их убраться и допустили в народное собрание только лишь по настоятельным требованиям мантинейцев и элейцев (ТИис. V.61.1).

Очевидно, что сторонники олигархического правления в Аргосе переоценили уровень своего влияния. Им не удалось подтолкнуть Аргос к образованию альянса со Спартой, как было обещано Агису, положение которого теперь оставляло желать лучшего (ТИис. V.63.1-4). Ситуация, в которой оказалась Спарта, была близка к критической. Лакедемоняне не могли отдать Тегею противнику и начали готовиться к полномасштабным военным действиям.

Трудно судить наверняка о том, какое участие принимали в битве при Манти-нее про-спартански настроенные сторонники олигархического правления. Некоторые исследователи полагают, что Агис спланировал битву так, чтобы в ней не пострадали аргосские олигархи. Так, Вудхаус пишет, что с тысячей отборных аргивян, которые были рекрутированы из наиболее богатых аргосских семей и, которые придерживались далеко не демократических убеждений, обращались по приказу Агиса наиболее мягко12. А. Гомме, подвергая жесткой критике практически все аргументы Вуд-хауса, ставящего под сомнение свидетельства Фукидида, выражает противоположную точку зрения13. По свидетельству Диодора (X11.75.7; ХМ.79.4), аргивяне из упомянутой тысячи, будучи освобожденными от другой общественной повинности, состоящие на государственном обеспечении Аргоса и постоянно занимающиеся военными тренировками, были настоящими мастерами военного дела. Диодор также пишет, что во время битвы советник Фаракс убедил царя лакедемонян дать аргосским лога-дам возможность свободного прохода, чтобы не подвергать опасности людей, жертвующих жизнью (РюЬ. X11.79.6). Вряд ли может вызвать удивление то, что потери этого отряда были незначительными по сравнению с потерями менее подготовленных мантинейцев, воевавших бок о бок с ними.

Так или иначе, спартанцами была одержана победа над объединенными силами аргивян, афинян, мантинейцев и элейцев, и в очередной раз лакедемоняне стали полновластными хозяевами Пелопоннеса (ТИис. V.73.3).

Таким образом, очередной альянс с Афинами оказался для Аргоса еще менее успешным, чем союз 461 г., и не более успешным, чем попытка создать свою независимую лигу. Неудивительно, что после неудачной битвы при Мантинее сторонники лакедемонян, желавшие свергнуть демократию, получили все преимущества и, когда в начале следующей зимы 418/17 г. до н.э. спартанцы послали в Аргос мирные пред-

спартанцев, что привело бы к утрате надежды установить олигархический режим в Аргосе. Losada L.A. The Fifth Column in the Peloponnesian War. Brill Archive, 1972. P. 92-93.

11 Kagan D. Argive Politics and Policy after the Peace of Nicias // Classical Philology. 1962. Vol. 57. № 4. P. 212-213.

12 Woodhouse W.J. The Campaign and Battle of Mantinea in 418 B.C. // Annual of the British School at Athens. 1916-18. Vol. 22. P. 51-83.

13 В частности, Гомме указывает на несоответствие аргументов Вудхауса свидетельству Фукидида (V.73.2) о том, что Агис отдавал приказание всему своему войску выступить против мантинейцев и тысячи аргивян. Gomme A.W. Essays in Greek History and Literature. Salem, 1977. P. 150-151.

ложения, им не составило большого труда склонить народ к миру (ТИис. У.76.2). Вскоре после принятия этих мирных предложений та же самая партия аргивян, принявшая мирное соглашение с лакедемонянами, разорвала союз с афинянами, манти-нейцами и элейцами и заключила союз со Спартой. А весной 417 г. до н.э. лакедемоняне и аргивяне совместно покончили с демократией в Аргосе и установили там олигархию (ТИис. У.81.2). Политика сближения с лакедемонянами и подчинения интересов Аргоса Спарте привела к выступлениям против сторонников олигархов, и летом того же года аргосским демократам в результате уличных боев удалось вернуть себе власть. Однако какое-то время демократам приходилось мириться с достаточно большой группой противников, что подтолкнуло новое правительство к очередному сближению с Афинами. Как можно заключить из сообщения Фукидида, этот союз был лишь наименьшим из всех зол. Пользуясь помощью афинян, аргивяне приступили к возведению длинных стен до моря для отражения лакедемонян (ТИис. У.82.5-6)14. А в 416 г. до н.э. при участии Алкивиада схватили еще 300 сторонников спартанцев (ТИис. У.84.1), после чего олигархи утратили какую-либо возможность оказывать влияние на правительство, а аргосская политика уже больше не носила про-спартанский характер. В то же самое время вряд ли можно было назвать ее и про-афинской. Хотя Аргос и принимал участие в военных кампаниях, проводимых Афинами, это участие было скорее показательным, нежели реальным (ТИис. У!.7.1-2; VI! .26.1-3). Так, участие аргосских гоплитов в походе на Сиракузы Фукидид объясняет не столько союзническими мотивами, сколько враждебными чувствами к лакедемонянам (ТИис. V! 1.57.9).

ARGOS AND ARGIVE COALITION AFTER THE PEACE OF NICIAS

A.V . UNZHAKOV

Nizhny Novgorod Linguistic University

n.a. N.A. Dobrolyubov e-mail: [email protected]

This article attempts to analyze the conditions in which Argos found herself after the Peace of Nicias was concluded between Athens and Sparta; the opportunities which enabled Argos to start creating her independent coalition of states; and the causes which led to Argos’ failure and loss of her leading role. The author believes that Argive policy in the researched period as well as in earlier times should be characterized as totally pro-Argive, based on a pragmatic approach and aimed at a search for ways which might enable Argos to gain a leading role in the life of Greece.

Key words: Argos, Athens, Corinth, Lacedaemon, Sparta, Peace of Nicias, polis, league.

14 По всей видимости, часть строительства финансировалось Афинами, т.к. финансовая помощь Аргосу против Спарты предусматривалась договором 416 г. Известно также, что оплата осуществлялась в основном кизикенскими статерами. Blamire A. Athenian Finance, 454-404 B.C. // Hesperia. 2001. Vol. 70. №1. P. 113.

Greece Guideline > Памятные места > Древняя агора Аргоса

Город Аргос на Пелопоннесе – это самый старый непрерывно населенный городом в Греции – его история насчитывает порядка 5000 лет. Все значимые археологические объекты Аргоса сосредоточены в одном месте. Неподалеку от уникального вырубленного в скале древнего театра, сразу через дорогу находится Древняя агора – рынок и главное публичное место горожан .

По мнению археологов Древняя агора Аргоса возникла в VI веке до н.э. в южной части города, на пересечении путей, ведущих в Коринф, Тегею и Герион. Окончательную форму Агора обрела в конце IV века до н.э.. В классический и эллинистический периоды внешний вид рынка определялся аркадами и зданиями, которые в наши дни довольно не сильно выделяются на фоне всего, что было построено позднее.

Один из самых интересных объектов Древней агоры Аргоса можно назвать так называемый «колонный зал». Это довольно интересное строение (32,75 x 32,75 метров) с крышей, которую поддерживают шестнадцать ионических колонн. Что интересно, фасад строения украшают пятнадцать колонн, исполненных в дорическом стиле. Это здание появилось в 460 году до н.э., когда Аргос стал демократическим городом. Считается, что оно использовалось в качестве Булетериона – места встреч парламента в древние времена.

В южной части агоры расположено еще одно интересное здание с портиками и дорическими колоннами. Считается, что здесь располагалась палестра — древнегреческая школа борьбы. Палестры могли существовать как в составе государственных школ (гимназий), так и могли быть независимыми. Одним словом – палестра могла быть без гимназии, но гимназия без палестры – никогда.

Среди других останков можно выделить полукрытое театральное здание, к которому примыкают основа алтаря, предположительно храма Аполлона Ликеоса. Во времена Рима многие здания подверглись изменению и перестройке как по форме, так и функционально. Преимущественно это были магазины и фонтаны. Последнее крупное формирование внешнего вида агоры произошло в II-III века н.э..

Последний языческий памятник Древней агоры Аргоса датируется IV веком н.э.. Это был очаг, вокруг которого располагались колонны, позаимствованные с другого древнего памятника, посвященного «Семерым против Фив». Эта история посвящена мифическому военному противостоянию двух братьев, претендентовавших на трон Фив. Согласно мифу, братоубийственную войну из-за власти над Фивами накликал на своих сыновей Полиника и Этеокла сам Эдип. Он проклял их за ослушание и непочтительность. Братья, согласно уговору, должны были чередоваться в управлении фиванским царством, но Этеокл нарушил уговор, и Полиник бежал в Аргос, к царю Адрасту, который выдал за него свою дочь Аргею. Он обещал передать ему в наследие царство и согласился идти вместе с ним войной на Фивы. Несмотря на то, что аргивский прорицатель Амфиарай предсказывал несчастный исход войны для всех вождей, кроме Адраста, война была предпринята. В итоге оба брата погибли.

Миф был изложен в трагедиях Эсхила «Семеро против Фив», а последующие события — в его других произведениях. Также сюжет неоднократно перерабатывался другими афинскими трагиками.

Как добраться до Древней агоры Аргоса:

— на машине из Афин (127 км) по трассе Олипия Одос А8/Е94

— на машине из Нафплиона (11,8 км) по трассе Нафплион-Аргос

— на машине из Коринфа (48,4 км) по рассе Коринф-Триполи А7/Е65

— на автобусе из Афин с автовокзала Кифисью. Тел. автовокзала в Аргосе: +30 27510 69 323, тел. автовокзала в Нафплионе: +30 27520 27 323

Часы работы археологического сайта: 8:00-15:00, вход бесплатный.

Адрес: Пелопоннес, Аргос, пересечение улиц Театру и Триполеос

Фото и текст: Александр Фролов

The Ancient Agora of Argos

Right opposite the magnificent Ancient Theater of Argos, there is the Ancient Agora of this glorious city of the distant past, one more significant archaeological site that deserves a visit.

According to the archaeologists, the Ancient Agora of Argos had started to be organized by the 6th century BC in the south part of the city, in the central spot where the streets from Heraion, Corinth and Tegea ended. The building project was completed at the end of the 4th century BC. During the Classical and Hellenistic periods the agora (market) was defined by arcades and buildings that are difficult to be distinguished today under the various subsequent building phases.

However, among the most significant monuments that the archaeological excavations brought to light so far is a great pillared hall (32,75 x 32,75 meters) with a roof supported by 16 Ionic columns, while in the facade there were 15 Doric columns. It was built around 460 BC, when Argos had converted into Democracy, hence it is believed that this building was used as bouleuterion. Just for the record, the bouleuterion was the Parliament Speaker meeting place in the ancient Greek cities.

In the south side of the Agora, there is another great building with porticoes with Doric columns, which was probably the palaestra. The palaestra was the ancient Greek school of wrestling. It operated both independently and as part of public schools. So, although a palaestra could exist without a gymnasium (high school), a gymnasium would never exist without a palaestra.

Other revealed remains at the place belong to the beginning of a phase of the road, to a dome-nymphaeum, and a semi-circular theater building which includes the basis of an older altar, possibly of Apollo Lykeus. In Roman times, many of the existing buildings were altered in form and function, mostly shops and fountains, when the 2nd and the 3rd century AD a general reconstruction of the site took place.

The last monument of Paganism in the Ancient Agora of Argos was probably built in the 4th century AD and it was a hearth around which they had placed columns from a small enclosure of an heroon of the Archaic period that was dedicated to the “Seven Against Thebes”. The “Seven Against Thebes” is the name of a mythical military conflict between two brothers who claimed the throne of Thebes. According to the myth, Eteokles and Polinices were the sons of Oedipus, the king of Thebes, and Jokasta. After the death of Oedipus, the two brothers had initially agreed to govern Thebes alternately. However, when Eteocles refused to abide by the agreement and grant the throne to his brother, Polinices along with six more kings organized a military campaign against the king and the city of Thebes. At the end, the Thebeans were the winners, while both the two brothers were killed.

This conflict was also the theme of the homonymous tragedy of Aeschylus. The “Seven Against Thebes” of Aeschylus was actually the third part of his trilogy for the Thebean Cycle (a collection of four lost epics of ancient Greek literature related to the ancient Thebes) and the only one that is survived until today. With this magnificent tragedy, that was presented in Athens in 467 BC, Aeschylus won the poetry competition held during the first year of the 78th Olympiad.

The destruction and the annihilation of the monuments of the Ancient Agora was accelerated by the invasion of the Goths, in 395-396 AD, while the first archaeological excavations at the site began in 1904.

The Ancient Agora of Argos, Theatrou and Tripoleos street, Argos, Peloponnese. Visiting hours: 8:00-15:00. Free entrance.

How to get to Argos: By car from Athens (distance 127 km) via Olimpia Odos/A8/E94, from Nafplio (distance 11,8 km) via National Highway Argos-Nafplio, from Corinth (distance 48,4 km) via A/D Corinth-Tripoli/A7/E65 and National Highway Corinth-Argos. By bus from Athens and many Greek cities. Kifissou Bus Station (100 Kifissou street, Athens), tel.: +30 210 51 34 588. Argos Bus Station, tel.: +30 27510 69 323. Nafplio Bus Station, tel.: +30 27520 27 323.

Τext: Marilou Pantazi

ПелопоннесИсторияАрхеология

Argos | Ловел — промышленное оборудование

Инжиниринг, конструирование и производство систем оценки качества поверхностей плит и ремонт плитных материалов в деревообрабатывающей промышленности.

www.argossolutions.no

Системы ремонта панелей

Невероятно быстрое и точное оборудование

Система Argos для ремонта панелей (PRS) является быстрой и точной ремонтной системой для фанеры и других деревянных панелей. Система может легко быть настроена для решения многих ремонтных задач, таких как фасонное фрезерование, нанесение шпаклевки и 2-х компонентных заполнителей, например полиуретан и эпоксидка.

Система PRS без проблем передает данные от сканирующей системы на каждую ремонтную станцию. Каждая из этих станций состоит из точной X/Y системы управления движением, сочетающая высокую производственную скорость высокую точность с простотой работы. С системой Argos PRS вы сможете рассчитывать, что она превосходит другие решения как в производительности, так и в точности.

Система обнаружения неровностей

Абсолютно новая система обнаружения

Argos представляет первую в мире систему (CMS) для надежного и точного обнаружения неровностей после шлифовки. С системой CMS оператору шлифовального станка больше не нужно периодически останавливать шлифовальную линию и проверять возможные неровности после шлифовки. Проверка панелей мелом, наконец-то становится историей.

Вместе с системой оценки качества, Argos может поставить комплектную систему для обнаружения поверхностных дефектов, неровностей, измеритель толщины в одной объединенной системе за шлифовальным станком.

Оценка качества декоративных изделий

Самый высокоточный способ осмотра поверхности

Argos имеет совершенно новые системы взаимодействия и технологии, включенные в самое последнее поколение системы оценки качества Argos для визуальной инспекции декоративных панелей. Высококачественные изображения, выдаваемые самой последней камерой и твердотельными источниками света, обеспечивают обнаружение самых маленьких дефектов.

Наши инженеры при проектировании сконцентрированы на надежности и низких эксплуатационных расходах системы. Твердотельные источник света гарантируют максимальный срок эксплуатации и уменьшают необходимость частой калибровки системы. Новый дизайн делает ее легкой для модернизации. Новые улучшенные методы для автоматической чистки обеспечивают стабильную работу, а также уменьшает необходимость ручной чистки.

Системы оценки качества поверхности плит

ДСП, МДФ и ОСП

Объективная и точная система оценки качества

Огромное увеличение производственных мощностей и запрос на более высокое качество поверхности привело к повышенному интересу в автоматической оценке качества панелей. Человеку невозможно долго эффективно находить маленькие поверхностные дефекты в большой мастер-плите, двигающейся со скоростями около 100 м/мин. Система оценки качества Argos была спроектирована для обнаружения дефектов поверхности под эти условия. Система может сохранять в себе неограниченное число рецептов качества с концентрацией на максимизацию процентов высокого качества без уменьшения степени удовлетворения запросов заказчика.

Сильная сторона системы оценки качества Argos заключается в ее способности определять, распределять по категориям и классифицировать поверхностные дефекты. Многокамерные линейки и световые источники используются, чтобы фиксировать отдельные изображения дефектов в формате 2D и 3D. Изображения передаются в стандартный компьютер, где программа Argos анализирует фиксированные изображения поверхностных дефектов и сортирует плиту в соответствии с избранным рецептом качества. Цифровые сигналы, управляющие сортировщиком, активизируются в зависимости от результатов оценки качества.

Система оценки качества Argos может быть установлена за прессом, после шлифовального станка или совмещаться с обрезными операциями. Вмонтированный редактор рецептов позволяет обслуживающему персоналу определять точность рецептов. Точный рецепт оценки качества автоматически загружается во время смены производства, гарантирующее, что продукт сортируется в соответствии с его спецификациями. Система оценки качества Argos – это гарантия для эффективного производства продукции максимально высокого качества.

Обнаружение дефектов

Уникальное программное обеспечение для обработки изображения фирмы Argos обеспечивает высокую гибкость соответствия требованиям заказчика. Вмонтированная библиотека дефектов содержит отдельные для каждого дефекта регистраторы. Каждый дефект может быть проанализирован по различным размерам, и вся исследуемая плита может быть разделена на сектора и отсортирована по-разному. Редактор рецептов позволяет пользователям применять различные правила сортировки для верхней и нижней поверхностей в соответствии с производственными требованиями и запросами конечного заказчика. Фирма Argos может также разработать новые алгоритмы детектирования для специфических дефектов, имеющихся у заказчика.

Система оценки качества Argos может быть интегрирована с системами измерения толщины и другими устройствами контроля качества. Интегрированная база данных обеспечивает обслуживающий персонал в системе он-лайн точными статистическими производственными данными.

Параметры могут быть собраны от одной системы контроля или нескольких систем размещенных на одной или нескольких линиях.

Преимущества

100% проверка на всех скоростях.
По каждой плите оценивается качество.
Оценка качества осуществляется постоянно и под индивидуальный заказ.
Объективная сортировка, только необходимые дефекты переводятся в более низкий сорт.
Снижение стоимости рабочей силы.
Легко модернизировать, небольшая занимаемая площадь.
Точные отчеты и статистические данные, возможность управления ситуацией.
Улучшение процесса в технологической производственной цепочке, разработка обширных данных по плитам.Системы оценки качества поверхности для фанеры Из мягкой и твердой древесины и паркет

Обеспечение унифицированной и индивидуальной оценки качества

Традиционные механические видеосистемы используются в течение многих лет для оценки качества шпона, чтобы обеспечивать высокое использование наиболее ценных пород шпона. Система Argos может легко быть адаптирована к сортам всех пород натуральной древесины, используемой при производстве панелей из мягкой, твердой, паркетной и другой древесины. Система оценки качества Argos обеспечивает значительную экономию за счет исключения работников и обеспечения унифицированной и индивидуальной оценки качества каждой панели.

Argos предлагает комплексное решение для автоматической оценки качества продукции. Модульная и компактная конструкция может быть установлена или в линии пиления, за шлифовальным станком или во взаимодействии с дополнительными процессами, такими как ламинирование и окутывание. Для компаний, выполняющих ремонтную работу, Argos также предлагает полностью автоматическую систему ремонта панелей.

Система оценки качества Argos инспектирует как пласти, так и кромки плиты. Вмонтированный редактор рецептов позволяет обслуживающему персоналу определять точность рецептов для заказчиков и продукции. Точный рецепт оценки качества автоматически загружается во время смены производства, гарантирующее, что продукт сортируется в соответствии с его спецификациями.

Система оценки качества Argos – это гарантия для эффективного производства продукции максимально высокого качества.

Методы точного обнаружения и классификации по категориям

Сильная сторона системы оценки качества Argos заключается в ее способности определять, распределять по категориям и классифицировать поверхностные дефекты. Многокамерные линейки и световые источники используются, чтобы фиксировать отдельные изображения дефектов в формате 2D и 3D. Изображения передаются в стандартный компьютер и анализируются программой видеообработки Argos. Вмонтированная библиотека дефектов содержит отдельные для каждого дефекта регистраторы. Она хранит форму дефектов по размеру и размещению, и правила сортировки могут быть определены в соответствии с типом дефекта, расположения и количества.

Цифровые сигналы, управляющие сортировщиком, активизируются в зависимости от результатов оценки качества. Индивидуальная оценка качества зависит от точного обнаружения и классификации по категориям всех поверхностных дефектов, понижая сортность только по тем дефектам, которые не могут быть приняты заказчиком.

Преимущества

100% проверка на всех скоростях.
По каждой плите оценивается качество.
Оценка качества осуществляется постоянно и под индивидуальный заказ.
Объективная сортировка, только необходимые дефекты переводятся в более низкий сорт.
Снижение стоимости рабочей силы.
Легко модернизировать, небольшая занимаемая площадь.
Точные отчеты и статистические данные, возможность управления ситуацией.
Улучшение процесса в технологической производственной цепочке, разработка обширных данных по плитам.

Системы оценки качества для декоративных панелей

Меламин, тонкая пленка и мебель

Инспекция от небольших мебельных компонентов до полноразмерных панелей

Система оценки качества Argos является эффективным инструментом для автоматизации инспекции всех типов дефектов на декоративных поверхностях. Система спроектирована для обработки панелей всех размеров от маленьких мебельных компонентов до полноразмерных плит. Большое разнообразие декоров и поверхностных текстур, в сочетании с большими линейными скоростями, делает оценку качества декоративных панелей очень затруднительной, как для людей, так и для автоматических систем. Сам процесс и большое число отклонений декоров и подложек может создавать различные типы поверхностных дефектов. Каждый дефект становится видимым в зависимости от угла обзора и распределения света поперек плиты.

Имеется много производственных этапов, которые одинаково важны в получении точного и соответствующего результата оценки качества, и это все начинается с того, как фиксируется изображение.

Компактная, модульная конструкция системы оценки качества Argos включает многокамерные линейки и световые источники, чтобы фиксировать несколько изображений одной и той же поверхности. Множество изображений позволяет нашей программе видеообработки рассматривать дефект под различными углами, так же, как это делает человек, когда меняет позиции обзора, пытаясь найти дефекты.

Автоматическая оценка качества поверхности является унифицированной и изготовленной по индивидуальному заказу системой для того, чтобы получить оптимальные результаты в производстве продукции высокого качества и исключить недовольство заказчика.

Возможность увеличивать производство панелей высокого качества зависит от точности обнаружения, распределения по категориям и классификации различных дефектов. Уникальная Argos-программа видеообработки обнаружения и распределения по категориям дефектов, обеспечивает высокую гибкость настройки. Вмонтированная библиотека дефектов содержит отдельные для каждого дефекта регистраторы. Внедрение и распознавание различных рецептов оценки качества для продукции и заказчиков легко конфигурируется и поддерживается внутри Argos-редактора рецептов.

Преимущества

100% проверка на всех скоростях.
По каждой плите оценивается качество.
Оценка качества осуществляется постоянно и под индивидуальный заказ.
Объективная сортировка, только необходимые дефекты переводятся в более низкий сорт.
Снижение стоимости рабочей силы.
Легко модернизировать, небольшая занимаемая площадь.
Точные отчеты и статистические данные, возможность управления ситуацией.
Улучшение процесса в технологической производственной цепочке, разработка обширных данных по плитам.

Светодиодные Cветильники «Аргос-Трейд»-Санкт-Петербург

ООО «Торговая Компания «Аргос-Трейд» — уполномоченный торговый представитель завода «Аргос-Электрон», производящего источники питания (драйверы) для светодиодов, светодиодные модули, энергосберегающие светильники ЖКХ с датчиками присутствия (с источниками света: ЛОН, LED), датчики оптико-акустические.

Компания «Аргос-Электрон» — российский производитель светодиодной продукции. Производство продукции осуществляется при помощи автоматических линий, в состав которых входят такие элементы как установщики поверхностного монтажа фирмы «Panasonic», принтеры фирмы «DEK», печи конвекционные «BTU», линии пайки выводного монтажа «Kirsten», станки для штамповки корпусов изделий.

Основными направлениями деятельности компании сегодня являются:

Комплексные OEM поставки комплектующих, компонентов для производства светильников и электротехники;
Крупно-оптовые поставки светильников и комплектующих к ним оптовым организациям;
Оптовые поставки для нужд жилищно-коммунального хозяйства (ЖКХ) энергосберегающего оборудования, продукции для освещения подъездов жилых домов, а именно товаров: энергосберегающие светильники, выключатели для автоматического включения/выключения освещения, комплексные энергосберегающие системы освещения.

Производство полного цикла с современным оборудованием, собственные разработки и использование наиболее высококачественных, часто специально изготавливаемых комплектующих — это основные составляющие нашего успеха.

Одним из преимуществ компании является полноценное производство — от светодиодного модуля до целого осветительного прибора с датчиками, светодиодами, драйвером и другими необходимыми элементами. Мы комплектуем приборы обычными оптико-акустическими датчиками и микроволновыми сенсорами движения с функцией дежурного режима.

Сначала отдельные электронные платы, а затем и готовый произведенный продукт проходят несколько этапов тестирования, проверку на прогонных стендах и контроль качества, после чего мы гарантируем каждому потребителю стопроцентную работоспособность устройства, соответствие заявленным характеристикам, функциональность всех датчиков и долговременную бесперебойную работу прибора. Подобные меры обеспечивают нам преимущество перед компаниями, которые в производстве используют дешевые комплектующие изделия и не тратят время на многочисленные проверки.

Другим весомым преимуществом Аргос как производителя светодиодных светильников ЖКХ является идентичное исполнение серийных моделей. То есть любой светильник из определенной серии идентичен другой модели, произведенной год назад. Это объясняется собственным производством всех составляющих и тщательным контролем при производстве.

Отличное знание каждой детали и элемента, большой опыт эксплуатации приборов позволяет нам создавать точные алгоритмы использования и рекомендовать потребителям оптимальные варианты для конкретного применения.

Мы стараемся предусмотреть любые неудобства для клиента и предупредить их. Наша продукция безопасна, создается с учетом удобства монтажа и надежности эксплуатации, оснащена защитой от действий вандалов, воров и хулиганов.

Все товары, произведенные в компании, проходят испытания на электробезопасность, что подтверждается соответствующими протоколами и декларацией соответствия. Наши светильники способны работать без перебоев, поддерживают электромагнитную совместимость с остальными бытовыми приборами.

Светодиоды, используемые производителем светильников ЖКХ Аргос, обладают высокой эффективностью и ресурсом работы, определенным в соответствии LM80 — это международный стандарт, обозначающий время работы светодиода для достижения определенной степени деградации параметров, обеспечивая оптимальный режим работы для значительного увеличения их надежности — такой подход немного повышает стоимость приборов, однако позволяет гарантировать потребителю заявленный период работы и безупречное функционирование.

Производство полного цикла

Многоэтапный контроль качества

Точное и качественное исполнение

Другим весомым преимуществом Аргос как производителя светодиодных светильников ЖКХ является идентичное исполнение серийных моделей. То есть любой светильник из определенной серии идентичен другой модели, произведенной год назад. Это объясняется собственным производством всех составляющих и тщательным контролем при производстве.

Внимание к деталям

Безопасность продукции

Качественные светодиоды

ООО «ТК Аргос-Трейд»

Россия, 192236, г. Санкт-Петербург, Софийская ул,
д. 8, корпус 1, лит. Б

Сообщество | Аргос Научный | Global

«Уважаемый Argos Scientific, Большое спасибо за пожертвование средств на наш забег на 10 км в средней школе Нобеля! Мы рады сообщить, что забег состоялся во вторник, 24 мая, в колледже Пирс, и он прошел с огромным успехом! В этом году в школе два ученика борются с раком, поэтому все бегуны носили золотые ленточки, чтобы выразить свою поддержку. Еще раз спасибо! Желаем всего наилучшего!»

— Миссис Когл и волонтеры 10 000 Нобелевской средней школы

Многие клиенты, которые использовали наши продукты и услуги, использовали наш опыт для разработки долгосрочных программ мониторинга воздуха, которые сочетают современное оборудование для мониторинга воздуха с программами участия сообщества. Синтез этих двух услуг представляет собой устойчивые программы мониторинга воздуха, которые возвращаются сообществу в виде:

(1) Данные мониторинга воздуха в режиме реального времени

(2) Образовательные программы

(3) Расширенные экстренные меры возможности реагирования.

Небольшие затраты на эти интегрированные программы обеспечивают огромную долгосрочную выгоду для всех местных заинтересованных сторон. Ниже приведены несколько примеров успешных программ общественных благ, разработанных Argos.

КАЛИФОРНИЯ

В настоящее время компания Argos работает с различными нефтеперерабатывающими заводами, общественными группами и местными властями над созданием систем мониторинга воздуха в режиме реального времени в Калифорнии. Являясь техническим связующим звеном между нефтеперерабатывающим заводом и общественными группами, Argos отвечает за поддержку систем мониторинга в режиме реального времени, которые обновляют общедоступный веб-сайт каждые пять минут. Он предоставляет рекомендации по новейшим методам отбора проб атмосферного воздуха и гарантирует, что все оборудование соответствует стандартам обеспечения качества.

Успех мониторинга ограждений включает в себя программы мониторинга на уровне сообществ, в которых используются современные методы отбора проб для выявления пахучих газов и отслеживания их источника. Кроме того, по просьбе лидеров местных сообществ Argos разрабатывает серию образовательных вебинаров, посвященных методам отбора проб окружающей среды.

БЛИЖНИЙ ВОСТОК

С помощью новой системы отбора проб воздуха, разработанной Argos Scientific Inc., нефтеперерабатывающий завод в Южной Африке разработал транспортное средство для реагирования сообщества, которое реагирует на все: от разливов опасных отходов, жалоб местного населения на запах до проблем безопасности рабочих. . Пробоотборник получает данные каждые 30 секунд и может определять количество бензола, толуола, ксилола, диоксида серы, оксида азота, ртути и аммиака в режиме реального времени.

Пределы обнаружения для этих газов находятся в нижней части на миллиард. Применяя агрессивный подход к поиску и обнаружению запахов, нефтеперерабатывающий завод смог снизить количество жалоб на запах на 40%, продемонстрировав, что тип обнаруженного газа и направление ветра не были со стороны нефтеперерабатывающего завода. В свою очередь, были выявлены фактические источники газов и приняты меры по смягчению последствий.

СРЕДНИЙ ЗАПАД

Используя технологию, разработанную Argos Scientific, общественная группа на Среднем Западе смогла задокументировать небезопасные уровни 1-3 бутадиена, поступающие от компании по производству пластмасс. Эти данные использовались, чтобы побудить компанию, EPA и сообщество работать над общим решением проблемы. Сегодня уровни бутадиена в обществе ниже санитарных норм. В настоящее время Argos работает с компанией над обеспечением регулярного мониторинга 1-3-бутадиена, акрилонитрила и стирола.

ЮЖНАЯ АФРИКА

С помощью новой системы отбора проб воздуха, разработанной Argos Scientific Inc., нефтеперерабатывающий завод в Южной Африке разработал транспортное средство реагирования сообщества, которое реагирует на все: от разливов опасных отходов, жалоб сообщества на запах до проблем безопасности рабочих. . Пробоотборник получает данные каждые 30 секунд и может определять количество бензола, толуола, ксилола, диоксида серы, оксида азота, ртути и аммиака в режиме реального времени.

3 марта 2016 г., Портер-Ранч, Калифорния. Независимая частная компания Argos Scientific, у которой есть соглашение о размещении мониторов в домах жителей через офис члена городского совета Лос-Анджелеса Митча Энгландера, также останется на месте и хотела бы найти долгосрочный дом для оборудования, сказал Дон Гамилес из Argos Scientific. Компания настроила жителей для просмотра результатов в режиме реального времени на своих смартфонах.

«Был огромный отклик», — сказал Гамилес, добавив, что сайт получил более 100 000 посещений. «В мире мониторинга воздуха это затмевает все остальные рекорды», — сказал он. «Мы все еще видим уровни метана, я бы сказал, значительно выше, чем должны быть фоновые уровни».

Как работает система Argos и как собираются данные Argos?

Home Использование Argos Как работает система Argos?

Argos — это уникальная всемирная система определения местонахождения и сбора данных, предназначенная для изучения и защиты окружающей среды.

Получить доступ к данным Argos

Передатчики Argos PTT

Любое оборудование, интегрирующее передатчик, сертифицированный Argos, называется «сертифицированным для платформы Argos». Передатчики Argos, работающие от батарей или солнечной энергии, загружают короткие сообщения (менее одной секунды) в инструменты Argos на спутниках, которые пролетают над головой на высоте 850 км.

Каждая платформа характеризуется идентификационным номером, характерным для ее передатчика. Платформа передает периодические сообщения , характеризующиеся следующими параметрами:

Частота передачи (401,650 МГц ± 30 кГц , которая должна быть стабильной, поскольку местоположение вычисляется на основе измерений эффекта Доплера, Период повторения , который представляет собой интервал времени между двумя последовательными отправками сообщений, варьирующийся от 90 до 200 секунд в зависимости от степени использования платформы, идентификационного номера платформы и объема собранных данных9.0094
Передача каждого сообщения занимает менее одной секунды.

См. PTT Argos

Спутники

Спутники на полярной орбите, собирающие данные: летающие на орбите высотой 850 км над Землей принимают сигналы, сохраняют их на борту и передают в режиме реального времени обратно на Землю .

Спутники находятся на полярной орбите на высоте 850 км

Спутники видят Северный и Южный полюса на каждом орбитальном обороте. Плоскости орбит вращаются вокруг полярной оси с той же скоростью, что и Земля вокруг Солнца, т.е. один оборот в год. Каждый орбитальный оборот пересекает экваториальную плоскость в фиксированное местное солнечное время. Таким образом, каждый спутник проходит в пределах видимости любого заданного передатчика почти в одно и то же местное время каждый день. Время, необходимое для совершения оборота вокруг Земли, составляет примерно 100 минут.

В любой момент времени каждый спутник одновременно «видит» все передатчики в радиусе примерно 5000-километрового «следа» или круга видимости. По мере движения спутника по орбите круг видимости охватывает 5000 километров вокруг Земли, километров охватывая оба полюса.

Из-за вращения Земли полоса обзора смещается на 25° к западу (2800 км на экваторе) вокруг полярной оси при каждом обороте. Это приводит к перекрытию между последовательными рядами. Поскольку перекрытие увеличивается с широтой, количество ежедневных проходов над передатчиком также увеличивается с широтой.

На полюсах спутники видят каждый передатчик при каждом проходе, примерно 14 раз в день на спутник.

Период, в течение которого спутник может принимать сообщения от платформы, эквивалентен времени, в течение которого платформа находится в пределах его видимости. В среднем это 10 минут.

Сообщения Argos принимаются спутником одновременно. Они сохраняются на бортовом самописце и ретранслируются на Землю каждый раз, когда спутник проходит над одной из трех основных приемных станций, базирующихся на острове Уоллопс (Вирджиния, США), Фэрбенксе (Аляска, США) и Шпицбергене (Норвегия). либо они ретранслируются на землю на региональные приемные станции в поле зрения спутников.

Приемные станции

Почти 70 станций принимают данные со спутников в режиме реального времени и ретранслируют их в центры обработки. Эта дистрибьюторская сеть обеспечивает покрытие в странах мира.

Три основные принимающие станции, остров Уоллопс и Фэрбенкс в США и Шпицберген в Норвегии, собирают все сообщения, записанные спутниками во время движения по орбите, обеспечивая тем самым покрытие всей Земли.

Данные, полученные спутниками ретранслируется на региональные станции в режиме реального времени , если станция находится в пределах видимости спутника. Основные приемные станции также принимают данные в режиме реального времени.

Существует две категории станций:

Для режима « региональный» сеть станций L-диапазона покрывает большую часть Земли и получает данные радиомаяка в реальном времени со спутника, когда он находится в зоне действия станции. Маяки загружают свои данные на спутник, когда он проходит над головой. Эта сеть обеспечивает более быструю маршрутизацию данных, полученных на борту, к пользователям, но не позволяет полностью охватить Землю.
Для «глобального» режима основные приемные станции (обычно в диапазоне X) собирают все сообщения, записанные спутниками на полной орбите, что обеспечивает глобальное покрытие системы. Эти три станции на острове Уоллопс, в Фэрбенксе в США и на Шпицбергене в Норвегии также получают данные в режиме реального времени.

Центры обработки

Имеется два глобальных центра обработки Argos , один из которых расположен недалеко от Тулузы на юго-западе Франции, в штаб-квартире CLS, а другой — недалеко от Вашингтона, округ Колумбия, США. Как только данные поступают в центр обработки, местоположения автоматически рассчитываются, и информация становится доступной для пользователей.

В двух центрах обработки, рассчитанных на полное резервирование, компьютеры вычисляют местоположения и обрабатывают полученные данные.

В глобальных центрах обработки данных выполняется следующая обработка:

Проверка качества сообщения, уровня приема, временных меток, идентификационного номера передатчика, длины сообщений датчиков и значения частоты приемника (для расчета местоположения)
Время сообщения -тегирование по всемирному координированному времени (UTC)
Классификация сообщений по платформам и в хронологическом порядке
Обработка данных

Все эти результаты сохраняются и предоставляются пользователям Argos.

Пользователи Argos по всему миру получают данные непосредственно в своем офисе или на месте, в зависимости от их выбора (по электронной почте, факсу, веб-соединению, компакт-диску или непосредственно в картографическом программном обеспечении). Как только данные получены, они часто передаются научному сообществу или распространяются среди правительств или отраслей, которые используют данные в качестве важных инструментов управления.

Узнайте больше о том, как получить доступ к Argos Data

22000 Активные передатчики в мире

8000 Животные с меткой и отслеживаемыми

100 Страны пользователей во всем мире

Часто задаваемые вопросы — UIT

9 UIT.
Аргос
Часто задаваемые вопросы

Нажмите на вопрос, чтобы просмотреть ответ.

Общий

Должен ли я использовать Argos?

Нет, вы не обязаны использовать Argos. Свяжитесь с вашим MTL, чтобы помочь вам определить лучший инструмент отчетности для ваших нужд. См. контактную информацию MTL на левой боковой панели.

Заменяет ли Argos платформы приложений, такие как Apex и MS Access?

Нет, Argos не является инструментом разработки приложений и не был реализован для замены Апекс и MS Access.

Argos работает через Интернет, безопасно ли это?

В приложениях Argos используются лучшие практики ИТ-безопасности и они соответствуют всем требованиям MSU. требования безопасности. Приложения включают веб-приложение Argos Web Viewer, которое использует SSL-соединение для шифрования связи между ним и браузером, а клиент/серверная версия, не основанная на Web. Все отчеты МГУ разработаны для версии клиент/сервер.

Начало работы

Как начать пользоваться Argos?

Для начала свяжитесь с вашим MTL и просмотрите сайт Evisions.

См. контактную информацию MTL на левой боковой панели.

Какие специальные знания/навыки необходимы для использования Argos?

Если у вас есть вопросы о том, следует ли вам быть Report Writer или DataBlock Designer в Аргосе, пожалуйста, свяжитесь с вашим MTL для получения рекомендаций по конкретным знаниям/навыкам, которые вы понадобится.

Доступно ли обучение Argos?

Да, это так. Просмотрите учебный сайт Evisions и обсудите свое желание пройти обучение со своим руководителем и MTL.

См. контактную информацию MTL на левой боковой панели

У меня проблемы со входом в iData или Argos, что мне делать?

Что может сделать Аргос?

Могу ли я использовать Argos для составления отчетов по нескольким источникам данных?

Да, Argos может создавать отчеты из нескольких источников данных. При создании панели мониторинга она учитывая соединение по умолчанию (например, баннер), однако каждый объект на панели инструментов может переопределить это, позволяя выбрать другое соединение (например, DegreeWorks). Данные из объекта, имеющего одно соединение, затем можно использовать при выполнении объект, использующий другое соединение.

Поддерживает ли Argos кубы OLAP?

Как я могу использовать Argos для создания и представления письма?

Да, Argos может создавать PDF-документы, которые можно прикрепить к электронному письму или распечатать и отправил по почте. Выходные данные также могут быть представлены через веб-браузер либо публично, либо внутри MyInfo требует аутентификации, если это необходимо.

Есть ли в Argos функция детализации?

Да. Используя диаграмму, пользователь может выбрать диаграмму или элемент в диаграмме и управлять другая форма для отображения с использованием данных, которые были выбраны пользователем в оригинале диаграмма.

Есть ли в Argos встроенный редактор SQL для устранения неполадок?

Нет. Argos не является средством разработки SQL. Мы рекомендуем использовать SQL Developer или аналогичный инструмент.

Университет информационных технологий

Почтовый индекс Box 173240
Bozeman, MT 59717-3240

Служба поддержки UIT
Тел. : 406-994-1777
[email protected]
www.montana.edu/uit/servicedesk

Портал обслуживания и поддержки UIT

Адрес: Renne Library, 1th floor Room 1165G 900 :
с понедельника по четверг с 8:00 до 17:00. [Лично и по электронной почте/телефону/удаленно]
Понедельник — Четверг, 17:00. — 19:00 [ТОЛЬКО дистанционно]
Пятница, с 8:00 до 17:00. [Лично и по электронной почте/телефону/удаленно]
, кроме праздников и перерывов

Вице-президент по информационным технологиям и информационным технологиям:

Доктор Райан Кнутсон
[электронная почта защищена]

Аргос | Злодеи Вики | Fandom

Аргос

Аргос — один из боссов в God of War: Betrayal .

Содержание

1 Внешний вид
2 Бог войны: предательство
3 Бог войны 3
4 силы и способности
5 Общая информация
6 Навигация

Внешний вид

Аргос — отвратительное существо с множеством шишек и глаз. Один из его глаз находится во рту.

God of War: Betrayal

Аргос — питомец Геры. Он был послан (предположительно) Герой, чтобы убить Кратоса, потому что и он, и его спартанская армия были полны решимости положить конец равновесию в Греции. Аргос несколько раз сражался с Кратосом. Но каждый раз Аргос всегда убегал, прежде чем его можно было убить. После последней битвы между Аргосом, Аргос упал в канализацию. Когда Кратос последовал за ним, Аргос был убит неизвестным убийцей. Это было так, что Кратоса можно было обвинить как в убийстве Аргоса, так и в осаде города.

God of War 3

Модель Аргоса ( God of War 3 ).

На самом деле Аргос должен был стать одним из боссов или существ в God of War 3, и есть даже модель этого существа. Однако Аргос был исключен, потому что Аргос практически ничего не имел для истории и не подходил.

Силы и способности

Аргос — крупные существа. Известно, что он медленный, но невероятно сильный. Он также известен прыжками на большие расстояния.

Общая информация

Этот враг основан на греческом мифическом великане Аргусе Паноптесе. Согласно некоторым мифам, когда Аргус был убит, Гера забрала все его глаза и поместила их на черты хвоста павлина.

Злодеи

Анимационные фильмы
Король Бохан | Лорд Воронов | Председатель Дрек | Доктор Нефариус | Виктор фон Ион

Argos — Студенческие записи — UA Little Rock

Argos — это полезный инструмент отчетности, который позволяет UA Little Rock удовлетворять большинство своих потребностей в отчетности. Следующие страницы помогут вам понять и использовать отчеты Argos, которые относятся к и предоставляются Управлением документации и регистрации

Чтобы использовать этот инструмент, вы должны сначала получить доступ. Ссылки на онлайн-обучение и онлайн-форму запроса доступа можно найти здесь.

После получения доступа вы можете войти в Argos по телефону:

Перейти на evisions.ualr.edu
Вам будет предложено ввести имя пользователя и пароль. Имя пользователя будет вашим NetID, а Password будет паролем, связанным с вашим NetID.
После ввода этой информации вы сможете получить доступ к любому отчету, к которому у вас есть доступ. Полный список отчетов Argos, используемых или предоставленных Управлением документации и регистрации, можно найти в меню в левой части этого экрана. Если у вас есть какие-либо вопросы или опасения по поводу этих отчетов, пожалуйста, не стесняйтесь обращаться в Управление документации и регистрации.

Представленные окончательные оценки

Отчет «Поставленные окончательные оценки» позволит вам просмотреть все окончательные оценки, отправленные в отделе, к просмотру которого у вас есть доступ.

Чтобы получить доступ к этому отчету, вам необходимо развернуть следующие папки:

UALR
Отчеты кампуса
Студент
Общий
Дважды щелкните Представлены итоговые оценки

Чтобы запустить отчет, вам нужно будет выбрать термин из раскрывающегося меню. Как только вы это сделаете, в отчете будут перечислены все отделы, к которым у вас есть доступ для просмотра. Выберите отдел, который вы хотите просмотреть, и в отчете будет отображаться следующая информация:

Каждый курс, предлагаемый выбранным отделением
Студенты этих курсов
Итоговая оценка, которую студент получил за указанный курс

Зачисление студентов по отделам

В отчете о зачислении студентов по отделам будут перечислены все учащиеся для каждого класса в отделе, на просмотр которого у вас есть разрешение.

Чтобы получить доступ к этому отчету, вам необходимо развернуть следующие папки:

UALR
Отчеты кампуса
Студент
Общий
Набор студентов по отделам
Дважды щелкните Список студентов

После того, как вы открыли отчет, вам нужно будет выбрать термин, который вы хотите просмотреть, из раскрывающегося меню. После того, как вы выбрали термин, вам будет предложено выбрать отдел из списка. Вы можете выбрать несколько колледжей:

Наведя указатель мыши на несколько колледжей
Удерживайте Shift при использовании клавиш со стрелками для перемещения вверх и вниз по списку
Удерживайте клавишу Ctrl при выборе отдельных колледжей с помощью мыши
Вы можете просматривать только те курсы, которые открыты для регистрации

После того, как вы сделаете свой выбор, в отчете будет создан список учащихся, который вы можете просмотреть. Чтобы создать список, разверните окно и выберите один из трех вариантов в правом верхнем углу экрана: синий диск сохранит отчет в файле .csv на вашем компьютере, белая буква отправит копию отчета по электронной почте на указанный адрес электронной почты, а зеленый болт сохранит отчет и откроет его в файле .csv для просмотра.

Сведения о учащемся (QV)

Этот QuickView отображает следующую информацию: Подтверждение регистрации, Количество часов регистрации, Классификация, Последний зарегистрированный семестр, Активное приложение и любые задержки регистрации. Вся информация, за исключением запретов, основана на выбранном термине.

Чтобы получить доступ к этому отчету, вам необходимо развернуть следующие папки:

UALR
Отчеты кампуса
Студент
Общий
Дважды щелкните Сведения о студенте (QV)

Чтобы запустить этот отчет, сначала необходимо ввести идентификационный номер троянской программы учащегося или номер социального страхования в поле . Введите идентификатор учащегося . Затем вам нужно будет выбрать термин из выпадающего меню. В это время должно появиться имя учащегося. Если имя отличается от того, которое вы хотели, или имя не должно отображаться, проверьте поле Введите идентификатор учащегося на наличие ошибок.

После выбора термина появится следующая информация:

Информация о подтверждении регистрации: Если студент подтвердил регистрацию на выбранный вами семестр, будет предоставлен его номер подтверждения регистрации.
Зачисление: будет показано количество часов, зачисленных на выбранный срок.
Классификация: будет отображаться классификация учащегося ( т. е. первокурсник, второкурсник и т. д. )
Последний зарегистрированный семестр: будет отображаться последний раз, когда студент посещал курсы в UA Little Rock.
Заявление об окончании школы: если учащийся подал заявку на получение диплома, эта информация появится в первом белом поле.
Задержки регистрации: Любая задержка регистрации появится во втором белом поле.

Ограничения курса

В этом кратком обзоре перечислены ограничения, существующие на уровне каталога в Banner. Ограничения, содержащиеся в этом блоке данных, применяются компанией Banner. Эти ограничения основаны на выбранном термине.

Чтобы получить доступ к этому отчету, вам необходимо развернуть следующие папки:

УАЛР
Отчеты кампуса
Студент
Общий
Дважды щелкните Ограничения курса

Чтобы заполнить поля этого быстрого просмотра, выполните следующие действия:

Выберите термин из раскрывающегося меню
Выберите тему из выпадающего меню
Выберите курс из раскрывающегося меню

Поля под раскрывающимися меню будут автоматически заполнены запрошенной вами информацией. Важно иметь в виду, что предоставленная информация будет действительна только в течение выбранного вами срока. Также важно отметить, что в полях (за исключением полей Pre-Requisite и Co-Requisite) будут перечислены требования, которым студент должен соответствовать, чтобы зарегистрироваться на курс.

Основные списки по фильтрам

Отчет «Основные списки по фильтрам» позволит вам просмотреть информацию об учащихся, к которой у вас есть доступ. Эта информация включает в себя информацию о специальностях, программах и среднем балле, а также другие детали.

Чтобы получить доступ к этому отчету, вам необходимо развернуть следующие папки:

UALR
Отчеты кампуса
Студент
Общий
Основные листинги по фильтрам
Дважды щелкните Список информации о студенте

После двойного щелчка по элементу «Список сведений об учащемся» появится всплывающее окно, в котором можно выбрать критерии. Текущий термин будет заполнен автоматически. Выберите термин для работы в раскрывающемся меню и выберите статус зачисления ваших учащихся (настройка по умолчанию для зачисления возвращает учащихся, которые зачислены и не зачислены). Вы также можете выбрать отдел.

Затем у вас есть возможность еще больше ограничить список студентов, установив диапазон для среднего балла и общего количества заработанных часов.

Студенческий билет
Имя ученика
Статус регистрации (на основе текущего срока)
Уровень
Программы начальной и средней школы
Условия первичного и вторичного каталога
степеней присвоено
Адрес электронной почты
часов заработано в UA Little Rock
Всего заработано часов
Совокупный средний балл

Основная контактная информация

Отчет «Основная контактная информация» содержит полезную контактную и основную информацию об учащихся, к которой у вас есть доступ.

Чтобы получить доступ к этому отчету, вам необходимо развернуть следующие папки:

UALR
Отчеты кампуса
Студент
Общий
Основная контактная информация
Дважды щелкните Список сведений о студенте

Текущий термин будет автоматически заполнен отчетом. Затем вам нужно будет выбрать термин для работы в раскрывающемся меню, выбрать статус зачисления ваших студентов (настройка по умолчанию для зачисления возвращает студентов, которые зачислены и не зачислены) и выбрать статус зачисления ваших студентов (значок настройка по умолчанию для статуса приема будет возвращать студентов, которые полностью зачислены и предварительно зачислены).

После того, как вы сделаете свой выбор, в отчете будет создан список учащихся, который вы можете просмотреть. Этот список также содержит следующую информацию о ваших учениках:

Студенческий билет
Имя ученика
Адрес
Уровень
Условия каталога
Степень
Майор
Адрес электронной почты

Проверка степени: использованный курс (QV)

В этом кратком отчете перечислены все правила в Banner, частью которых является выбранный вами курс. В нем также перечислены все другие курсы, для которых ваш конкретный курс соответствует предварительным требованиям.

Чтобы получить доступ к этому отчету, вам необходимо развернуть следующие папки:

УАЛР
Отчеты кампуса
Студент
Общий
Дважды щелкните Проверка степени: использованный курс (QV)

Чтобы использовать этот отчет,

Выберите термин, с которым вы хотите работать, из меню
Выберите курс, который вы хотите просмотреть
Изучите информацию, которая автоматически заполняется в двух таблицах
- Разделы/правила CAPP содержат следующую информацию:
  - Область, в которой есть ваш курс
  - Начальный срок, когда область впервые начала использовать ваш курс в качестве требования
  - Код правила, в котором есть ваш курс
  - Правило, в котором есть ваш курс
  - Начальный срок, когда правило впервые начало использовать ваш курс в качестве требования
- В обязательных требованиях Banner Enforced будет указана следующая информация:
  - Предмет и номер курса курса, для которого ваш курс является обязательным условием
  - Начальный срок, когда курс впервые начал использовать ваш курс в качестве требования

Внесены коррективы (QV)

В этом списке быстрого просмотра перечислены изменения, внесенные в степень или программу студента. Этот отчет предназначен только для тех, у кого есть необходимые разрешения для просмотра рассматриваемого учащегося.

Чтобы получить доступ к этому отчету, вам необходимо развернуть следующие папки:

UALR
Отчеты кампуса
Студент
Общий
Дважды щелкните Сделаны корректировки (QV)

Чтобы использовать эту форму, просто введите идентификатор студента в соответствующее поле. Любые корректировки, которые были внесены в программу или область учащегося, будут автоматически заполнены в соответствующих полях. Дополнительные изменения (такие как замена курса или отказ от него) будут отображаться в последнем поле.

Список утверждающих (QV)

Этот краткий отчет информирует пользователя о том, кому в его колледже предоставлены привилегии просматривать или утверждать заявления об окончании или запросы студентов на изменение их основного и/или дополнительного образования.

Чтобы получить доступ к этому отчету, вам необходимо развернуть следующие папки:

UALR
Отчеты кампуса
Студент
Общий
Дважды щелкните список утверждающих (QV)

Чтобы использовать этот отчет:

Выберите колледж из раскрывающегося меню
Выберите уровень (выпускник или бакалавриат), который вы хотите просмотреть, из раскрывающегося меню
В последнем раскрывающемся меню выберите «Заявка на получение диплома» или «Изменить основное/второстепенное значение»

Таблица будет автоматически заполнена информацией о лицах, которые имеют какой-либо доступ к этим запросам учащихся. В нем будет указан идентификатор, имя и должность человека, а также указано, есть ли у него доступ к просмотру и/или утверждению на уровне колледжа, факультета и программы.

Изменения курса для учащихся

Этот отчет позволит вам просмотреть подробную информацию об изменениях, предоставленных учащимся, на просмотр которых у вас есть разрешение.

Чтобы получить доступ к этому отчету, вам необходимо развернуть следующие папки:

UALR
Отчеты кампуса
Студент
Общий
Студенческий курс переопределяет
Дважды щелкните Переопределение курса для учащихся

Чтобы использовать эту форму, вам нужно выбрать термин, который вы хотите просмотреть, из выпадающего меню. Следующая информация будет автоматически заполнена для всех учащихся, которым было предоставлено переопределение и для которых у вас есть доступ к просмотру:

Студенческий билет
Имя ученика
Срок
CRN для курса, который студент получил вместо
Номер предмета/курса/раздела для курса, который учащийся получил вместо
Описание переопределения, полученного учащимся
Дата переопределения

Общий учащийся (QV)

Быстрый отчет общего учащегося содержит подробную информацию об учащихся, к просмотру которой у вас есть доступ.

Чтобы получить доступ к этому отчету, вам необходимо развернуть следующие папки:

UALR
Отчеты кампуса
Студент
Общий
Дважды щелкните General Student

Текущий термин будет автоматически заполнен отчетом. Затем вам нужно будет выбрать термин для работы в раскрывающемся меню и выбрать статус зачисления ваших студентов (настройка по умолчанию для зачисления возвращает студентов, которые зачислены и не зачислены).

После того, как вы сделаете свой выбор, в отчете будет создан список учащихся, который вы можете просмотреть. В этом списке также будет указана следующая информация о ваших учениках:

Студенческий билет
Имя ученика
Классификация
Программы начальной и средней школы
Условия первичного и вторичного каталога
степеней присвоено
Статус регистрации (на основе текущего срока)
Статус конфиденциальности

После заполнения списка у вас есть возможность выбрать учащегося из этого списка. После того, как вы выберете учащегося, отчет будет содержать следующую информацию:

Каждый урок, который учащийся посещал в UA Little Rock:
- - CRN / Код предмета / Номер курса / Раздел / Название пройденного курса
  - часов, полученных за каждый курс
  - Оценка за каждый курс
Средний балл за последний семестр, который посещал студент, а также его академическая успеваемость в конце этого семестра
Общий средний балл учащегося
Список всех курсов, на которые в настоящее время зачислен студент, и семестр, в течение которого этот курс изучается

Эквивалентность перевода

Отчет о эквивалентности перевода был создан для просмотра того, как UA Little Rock принимает работу по переводу от других учреждений.

Чтобы получить доступ к этому отчету, вам необходимо развернуть следующие папки:

УАЛР
Отчеты кампуса
Студент
Общий
Перевод кредитного эквивалента
Дважды щелкните Перевод кредитного эквивалента

Чтобы запустить этот отчет, вы можете выбрать школу из раскрывающегося меню, а затем выбрать курс, который был или будет пройден. В таблице Equivalent будет показан выбранный вами курс, как он будет переведен в UA Little Rock и сколько кредитных часов будет переведено.

Вы можете ограничить поиск определенной темой и номером курса. Для этого:

Выберите школу, которую хотите исследовать
Выберите интересующую вас тему из раскрывающегося меню Тема
Введите номер курса, если вы его знаете

Список деканов

Отчет «Список деканов» был создан, чтобы пользователь мог видеть, какие студенты, на просмотр которых у них есть разрешение, были в списке деканов в течение выбранного ими семестра. В отчете также приводится средний балл студентов за этот семестр, а также некоторая основная контактная информация.

Чтобы получить доступ к этому отчету, вам необходимо развернуть следующие папки:

UALR
Отчеты кампуса
Студент
Общий
Дважды щелкните Список декана

Чтобы использовать этот отчет, выберите термин из раскрывающегося меню. После выбора термина вам будет предоставлена следующая информация:

Студенческий билет
Имя и фамилия студента
Студенческая начальная и средняя (если применимо) программы
Статус конфиденциальности студента
Адрес электронной почты студента
Фактический адрес студента
Средний балл студента за выбранный семестр

В отчете «Список деканов» также есть возможность составить черновик письма каждому студенту, которого вы видите в отчете. Был создан пример письма, которое можно изменить в соответствии с вашими индивидуальными потребностями.

Чтобы получить доступ к этому отчету, вам необходимо развернуть следующие папки:

УАЛР
Отчеты кампуса
Студент
Общий
Список декана
Двойной щелчок Пример: письмо со списком деканов

Затем выберите Редактировать отчет и Дизайн , чтобы внести необходимые изменения в письмо.

Планирование — Ограничения класса

Отчет «Ограничения класса» представляет собой снимок созданных курсов и статуса их регистрации. В этом отчете также будут перечислены любые ограничения класса, связанные с рассматриваемыми курсами.

Чтобы получить доступ к этому отчету, вам необходимо развернуть следующие папки:

UALR
Отчеты кампуса
Студент
Общий
Планирование
Дважды щелкните Ограничения класса

Чтобы создать отчет, вам необходимо сделать следующее:

Выберите термин, который вы хотите просмотреть
Выберите часть термина. Примечание. Даже если доступна только одна опция, вам нужно будет выбрать часть термина. Вам не разрешат продолжить, пока вы этого не сделаете.
Выберите колледж. Вы можете выбрать несколько колледжей:
- - - Перетаскивание мышью по нескольким колледжам
    - Удерживайте Shift, используя клавиши со стрелками для перемещения вверх и вниз по ограничениям
    - Удерживайте клавишу Ctrl при выборе отдельных колледжей с помощью мыши
Выберите отдел. Можно выбрать несколько отделов с помощью методов, упомянутых выше
Выберите статус курса.
- - - Вы можете просматривать только те курсы, которые открыты для регистрации
    - Только отмененные курсы
    - Как открытые, так и отмененные курсы
Вы можете установить флажок в поле «Статус курса», чтобы отображались только курсы, которым не назначено место.
Вы также можете просмотреть время встречи и инструктора определенного курса, выбрав курс в таблице быстрого просмотра
Затем выберите «Далее» в правом нижнем углу экрана, чтобы просмотреть, сохранить, отправить по электронной почте или запустить отчет.

Планирование — файл CSV-веб-курсы

Отчет о веб-курсах представляет собой снимок созданных онлайн-курсов и статуса их регистрации. Этот отчет содержит все сведения об онлайн-курсах и является предпочтительным методом аудита онлайн-курсов, созданных на определенный срок.

Чтобы получить доступ к этому отчету, вам необходимо развернуть следующие папки:

UALR
Отчеты кампуса
Студент
Общий
Планирование
Дважды щелкните файл CSV –веб-курсы

Чтобы создать отчет, вам необходимо сделать следующее:

Выберите термин, который вы хотите просмотреть
Выберите часть термина. Примечание. Даже если доступна только одна опция, вам нужно будет выбрать часть термина. Вам не разрешат продолжить, пока вы этого не сделаете.
Выберите колледж. Вы можете выбрать несколько колледжей:
- - - Перетаскивание мышью по нескольким колледжам
    - Удерживайте Shift при использовании клавиш со стрелками для перемещения вверх и вниз по списку
    - Удерживайте клавишу Ctrl при выборе отдельных колледжей с помощью мыши
Выберите отдел. Можно выбрать несколько отделов с помощью методов, упомянутых выше

Выберите статус курса.
- - - Вы можете просматривать только курсы, открытые для регистрации
    - Только отмененные курсы
    - Как открытые, так и отмененные курсы
Вы можете установить флажок в поле «Статус курса», чтобы отображались только курсы, которым не назначено место.
Вы также можете просмотреть время встречи и инструктора определенного курса, выбрав курс в таблице быстрого просмотра
После того, как вы сделаете свой выбор, в отчете будет создан список учащихся, который вы можете просмотреть. Чтобы создать список, разверните окно и выберите один из трех вариантов в правом верхнем углу экрана: синий диск сохранит отчет в файле .csv на вашем компьютере, белая буква отправит копию отчета по электронной почте на указанный адрес электронной почты, а зеленый болт сохранит отчет и откроет его в файле .csv для просмотра.

Планирование — CSV — Список классов

Отчет «Список классов» — это моментальный снимок созданных курсов и статуса их регистрации. Этот отчет будет генерировать все подробности о курсе и является предпочтительным методом аудита курсов, которые были созданы для семестра.

Чтобы получить доступ к этому отчету, вам необходимо развернуть следующие папки:

UALR
Отчеты кампуса
Студент
Общий
Планирование
Дважды щелкните Список классов CSV

Чтобы создать отчет, вам необходимо сделать следующее:

Выберите термин, который вы хотите просмотреть
Выберите часть термина. Примечание. Даже если доступна только одна опция, вам нужно будет выбрать часть термина. Вам не разрешат продолжить, пока вы этого не сделаете.
Выберите колледж. Вы можете выбрать несколько колледжей:
- - - Перетаскивание мышью по нескольким колледжам
    - Удерживайте Shift при использовании клавиш со стрелками для перемещения вверх и вниз по списку
    - Удерживайте клавишу Ctrl при выборе отдельных колледжей с помощью мыши
Выберите отдел. Можно выбрать несколько отделов с помощью методов, упомянутых выше
Выберите статус курса.
- - - Вы можете просматривать только курсы, открытые для регистрации
    - Только отмененные курсы
    - Как открытые, так и отмененные курсы
Вы можете установить флажок в поле «Статус курса», чтобы отображались только курсы, которым не назначено место.
Вы также можете просмотреть время встречи и инструктора определенного курса, выбрав курс в таблице быстрого просмотра
После того, как вы сделаете свой выбор, в отчете будет создан список учащихся, который вы можете просмотреть. Чтобы создать список, разверните окно и выберите один из трех вариантов в правом верхнем углу экрана: синий диск сохранит отчет в файле .csv на вашем компьютере, белая буква отправит копию отчета по электронной почте на указанный адрес электронной почты, а зеленый болт сохранит отчет и откроет его в файле . csv для просмотра.

Выпускной

В отчете Argos «Выпускной» содержится подробная информация о статусе выпуска учащихся, которую вам разрешено просматривать.

Чтобы получить доступ к этому отчету, вам необходимо развернуть следующие папки:

UALR
Отчеты кампуса
Студент
Общий
Дважды щелкните Выпускной

Награжден
Отклонено (в Баннере)
Отклонено (в BOSS)
Нет решения

После того, как вы выбрали свой выпускной статус, вам нужно будет выбрать один из статусов Баннера:

Все
В баннере
Нет в Баннере

Затем будет заполнена информация обо всех учащихся, к просмотру которых у вас есть доступ. Информация будет включать:

Адрес студента
Домашний и рабочий телефоны
Информация о желаемой степени
Награды
Даты и время активности приложения

Выпуск минус ONGA

Отчет Выпуск минус ONGA Argos предоставит подробную информацию о статусе выпуска учащихся, которую вам разрешено просматривать.

Чтобы получить доступ к этому отчету, вам необходимо развернуть следующие папки:

УАЛР
Отчеты кампуса
Студент
Общий
Дважды щелкните Градация минус ONGA

После того, как вы откроете отчет, вам будет предложено выбрать термин, который вы хотите исследовать, из раскрывающегося меню. Затем вам нужно будет выбрать свой отдел из предложенного списка. В этот список будут включены только отделы, с которыми вы связаны. Обратите внимание, : Даже если в этом списке отображается только один отдел, вам все равно нужно будет выбрать этот отдел, чтобы продолжить. После того, как вы выбрали свой отдел, вам нужно будет выбрать один из следующих статусов:

Награжден
Отклонено
В ожидании

Адрес студента
Домашний и рабочий телефоны
Информация о желаемой степени
Награды

FDA-ARGOS — это база данных с общедоступными эталонными геномами, прошедшими контроль качества, для использования в диагностике и научных исследованиях

Abstract

Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов (FDA) активно инвестирует в инструменты для поддержки инновационных технологий, таких как секвенирование нового поколения для инфекционных заболеваний (ID-NGS). Здесь мы представляем эталонные геномы, контролируемые FDA-ARGOS, в качестве общедоступной базы данных для диагностических целей и демонстрируем ее полезность на примере двух вариантов использования. Мы предоставляем показатели контроля качества для ресурса геномной базы данных FDA-ARGOS и подчеркиваем необходимость заполнения пробелов в качестве генома в открытом доступе. В первом варианте использования мы показываем более точную микробную идентификацию Enterococcus avium из метагеномных образцов с эталонными геномами FDA-ARGOS по сравнению с некурируемыми геномами GenBank. Во втором случае использования мы демонстрируем полезность эталонных геномов FDA-ARGOS для сравнения целевой последовательности вируса Эбола в рамках комплексной стратегии проверки для диагностических тестов ID-NGS. Использование FDA-ARGOS в качестве инструмента сравнения целевых последовательностей in silico в сочетании с репрезентативными клиническими испытаниями может снизить нагрузку на завершение клинических испытаний ID-NGS.

Введение

Пациенты и врачи нуждаются в альтернативных решениях, когда традиционная диагностика (например, ПЦР в реальном времени, посев или ИФА) не может определить инфекционную этиологию. В нескольких исследованиях документально подтверждена необходимость применения NGS без гипотез в качестве крайней меры диагностики, такой как популяция с высоким риском трансплантации или неудачная диагностика с помощью традиционной диагностики ^1,2 . Многочисленные группы успешно применили технологию ID-NGS в нескольких уникальных и разнообразных клинических случаях. Например, изолированная информация о секвенировании дробовика выявила неожиданные пути передачи во время вспышек внутрибольничных инфекций, устойчивых к множеству лекарств ^3,4,5 . Другие исследования показали использование целевого секвенирования для группировки клонотипов E. coli из прямых образцов мочи пациентов ⁶ или для выявления маркеров устойчивости к ципрофлоксацину ⁷ , что привело к получению данных о чувствительности к противомикробным препаратам и улучшению прогнозирования клинических исходов. Наконец, агностическое (беспристрастное, метагеномное) секвенирование обещает быть диагностикой последнего средства, когда никакая другая диагностика не может определить инфекционный микроорганизм, например, успешная диагностика лептоспирозной инфекции ID-NGS с положительным результатом для пациента ⁸ .

Диагностика инфекционных заболеваний с помощью секвенирования нового поколения (ID-NGS), позволяющая идентифицировать любой микробный организм или геномный маркер в образце пациента в одном тесте, готова к поступлению в клинико-диагностическую лабораторию ^9,10,11 . ID-NGS находит применение в сфере инфекционных заболеваний; тем не менее, несколько исследований подтверждают постоянную потребность в исследованиях NGS и курировании базы данных для облегчения внедрения в клинических условиях ². Возможно, лучший пример — Afshinnekoo et al. продемонстрировал неправильную идентификацию ID-NGS сибирской язвы и чумы в системе метро Нью-Йорка на основе низкокачественных эталонных геномов ¹² . Последующая опечатка, сделанная той же группой ¹³, выявила отсутствие доказательств наличия биологически опасных организмов в этих образцах. Эта опечатка приписывала ошибочную идентификацию сибирской язвы плохим эталонным геномам, что приводило к неправильной атрибуции генов токсинов при использовании инструментов анализа метагеномных данных. Это отсутствие надлежащих эталонных геномов широко распространено и представляет собой значительные пробелы в знаниях в общедоступных ресурсах, что подчеркивает необходимость целенаправленной разработки репрезентативных, точных и тщательно отобранных последовательностей эталонных геномов микробов. Дополнительные исследования показали, что эффективное использование независимой технологии секвенирования как для выявления инфекционных заболеваний, так и для исключения инфекционных этиологий напрямую связано с наличием полногеномных эталонных последовательностей контролируемого качества ^14,15,16 . По-прежнему требуются значительные усилия для перехода технологии ID-NGS в обычную клиническую диагностику. Чтобы облегчить этот переход, известные группы и исследователи в этой области наметили шаги, необходимые для правильного использования ID-NGS в клинике ^2,17,18 .

В этой рукописи представлено наше обоснование и показатели качества для эталонной базы данных генома FDA-ARGOS для создания инфраструктуры NGS, а также подчеркивается необходимость заполнения пробелов в геноме в открытом доступе. Кроме того, мы демонстрируем полезность базы данных FDA-ARGOS на примере двух вариантов использования: (1) точная идентификация E. avium из метагеномных образцов и (2) сравнение целевой последовательности в сочетании с репрезентативным клиническим тестированием в качестве составного эталонного метода (рис. 1) для диагностики ID-NGS.

Рис. 1

Предлагаемый составной эталонный метод (C-RM) для диагностики ID-NGS. Панель и иллюстрирует обход C-RM. Здесь мы показываем in silico сравнение целевой последовательности с эталонными геномами FDA-ARGOS в сочетании с репрезентативным клиническим тестированием, чтобы понять эффективность диагностических тестов ID-NGS. Используя необработанные данные последовательности из диагностического тестового устройства ID-NGS, сравнение in silico результатов, полученных с помощью внутренней базы данных анализа, с результатами, полученными при использовании FDA-ARGOS, позволит оценить конвейеры биоинформационного анализа устройства и создание отчетов, устраняя при этом необходимость в дополнительном тестировании образцов. с компаратором золотого стандарта (текущие контрольные показатели FDA). В целом, мы ожидаем использования C-RM на основе специфических для анализа подмножеств клинических образцов и/или микробных эталонных материалов (MRM) для клинической валидации в сочетании со сравнением целевой последовательности FDA-ARGOS in silico для получения научно обоснованных доказательств для понимания выполнение диагностических тестов ID NGS. Панель b перечислены необходимые показатели контроля качества для соответствия критериям эталонного генома нормативного уровня. Как минимум, эталонный геном FDA-ARGOS соответствует шести показателям (a–f). В частности, категория f детализирует минимальные требования к данным, которые далее описаны в ( c ). Кроме того, на панели d перечислены 10 критических метаданных, которые необходимо отнести к геному для соответствия критериям нормативного уровня

Полноразмерное изображение

Результаты

Заполнение целевых пробелов в геноме в общедоступных ресурсах

В 2013 году FDA в сотрудничестве с Министерством обороны (DoD) и Национальным центром биотехнологической информации (NCBI) оценило качество и разнообразие секвенированных микробных геномов, присутствующих в общедоступных базах данных. Большинство патогенов, по-видимому, были представлены множественными записями, однако многие из этих геномов были неполными или имели неизвестное качество. Фактически, тщательное изучение всего общественного достояния показало, что некоторые патогены были недостаточно представлены или полностью отсутствовали. Наш обзор 2013 г., поддержанный несколькими публикациями ^19,20,21 , выявили предвзятое филогенетическое покрытие, обычно связанное с финансированием исследований конкретных микробных модельных организмов. В то время NCBI GenBank охватывал <8000 последовательностей генома бактерий и архей, по крайней мере половина из которых была представлена четырьмя крупнейшими центрами секвенирования генома: Институтом Броуда, Объединенным институтом генома Министерства энергетики, Институтом геномных наук и TIGR/JCVI. Кроме того, во многих последовательностях отсутствовали сопутствующие метаданные и необработанная информация о прочтении. Эти проблемы послужили стимулом для создания de novo эталонных последовательностей, спонсируемых FDA, самого высокого качества, достижимого с использованием современных технологий геномного секвенирования 9. 1478 22 . Этими усилиями FDA намеревалось установить показатели контроля качества для микробных геномов, которые можно было бы использовать для валидации теста ID-NGS. Только геномы с наивысшим технически достижимым качеством могут квалифицироваться как геномы нормативного уровня. Факторами, необходимыми для достижения этой цели, были: (1) знание технологии, используемой для создания последовательностей, (2) доступ к необработанной информации о последовательностях для воспроизведения данных и (3) доступ к соответствующим метаданным. Возможно, наиболее важной недостающей частью информации для ранее созданных эталонных геномов было отсутствие независимого эталонного метода, который надежно связывал бы идентификацию микробного организма с данными последовательности. В этом контексте квалификация микробных эталонных геномов требует идентификации организма с помощью признанного эталонного метода, поскольку это остается основным требованием для валидации диагностического устройства.

FDA, DOD, NCBI и другие агентства выявили более 1000 диагностически важных высококачественных пробелов в геноме в общедоступных репозиториях микробных геномов, используя научную литературу, подход к филогенетическому анализу данных и руководящие документы FDA по конкретным видам микробов. Мы определили приоритет этих пробелов в геноме и выбрали диагностически значимые микроорганизмы, в том числе биологически опасные микроорганизмы, распространенные клинические патогены и близкие виды (https://argos.igs.umaryland.edu/doc/pdf/wanted-orgnaism-list-Jan2019)..pdf). Основная цель этого нормативного научного исследования и усилий по разработке инструментов была сосредоточена на создании исходного набора из 2000 микробных эталонных геномов FDA-ARGOS, прошедших контроль качества. Эти геномы создаются с помощью гибридного подхода к сборке с использованием технологий короткого и длинного чтения ²² . Первоначальный критерий сбора был направлен на секвенирование не менее пяти различных изолятов каждого вида, чтобы охватить временную и пространственную пластичность генома и инициировать создание модели микробного генома нормативного уровня.

Внедрение эталонных геномов для диагностических целей

Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов и его сотрудники создали общедоступную базу данных FDA dAtabase для микробиологических последовательностей регуляторного уровня (FDA-ARGOS), чтобы восполнить эти определенные пробелы в качестве диагностически важных геномов. Цель FDA-ARGOS — создать и сделать общедоступными почти готовые геномы достаточного качества для диагностических целей. Здесь мы представляем первое подмножество из 487 геномов FDA-ARGOS с образцами NCBI (рис. 2, дополнительные данные 1). Из 487 изолятов 88,3 % были бактериями, 11,1 % — вирусами и 0,6 % — эукариотами, что составляет 189разные таксоны. В общей сложности 81,9% геномов имели клиническое происхождение, а остальные 18,1% геномов окружающей среды принадлежали близкородственным видам, близким соседям (дополнительная таблица 1). В настоящее время проводится секвенирование более 1000 изолятов, которые находятся на разных этапах разработки генома FDA-ARGOS.

Рис. 2

Контроль качества эталонных геномов FDA-ARGOS для диагностического использования. Сводная статистика текущих 487 микробных геномов показывает, что в первую очередь FDA-ARGOS охватывает бактериальные изоляты, за которыми следуют вирусы, а затем эукариотические паразиты (9). 0345 и ). Дополнительные данные 1 содержат образцы для всех 487 геномов, доступных в настоящее время в открытом доступе. Большинство компонентов FDA-ARGOS ( b ) происходят из Северной Америки и получены из клинической изоляции человека

Изображение в полный размер

Использование передовых технологий секвенирования ²² помогло определить характеристики геномов нормативного уровня для диагностического использования. В частности, на рис. 1b представлена сводка необходимых показателей FDA-ARGOS для поддержки определения генома нормативного уровня. Все представленные FDA-ARGOS геномные данные продемонстрировали: (1) идентификацию организма перед секвенированием с помощью признанного независимого эталонного метода, (2) генерацию последовательности с использованием по крайней мере двух методологий секвенирования (например, длинное считывание и короткое считывание NGS) и (3) декомпозицию. новая сборка с большой глубиной покрытия основания. Последовательность собранного генома каждого микробного изолята соответствовала как минимум 95%-ное покрытие с 20-кратной глубиной в каждой позиции, а также обеспечение согласованных таксономически-специфических средних порогов идентичности нуклеотидов (ANI) NCBI для идентификации микробных организмов ²³ с независимыми методами идентификации. Все образцы FDA-ARGOS согласовывались между идентификацией секвенирования de novo и независимыми методами идентификации микроорганизмов (см. Дополнительную таблицу 1).

Как упоминалось выше, гибридная коррекция ошибок с технологией длинного и короткого считывания секвенирования рассматривалась для установления минимальных требований FDA-ARGOS к данным нормативного уровня. На рисунке 1c показаны эти критерии, в том числе: название образца, 10 полей метаданных (на основе требований к отправке биообразцов NCBI), необработанные чтения, сборки с покрытием, N50, L50 и аннотации. Важно отметить, что геномы FDA-ARGOS связаны как минимум с 10 критическими полями метаданных образца (рис. 1d): независимое подтверждение организма с помощью признанного эталонного метода, коллекция культур и следующие обязательные поля NCBI BioSample: организм, штамм, источник выделения, хозяин. , собранный, идентификатор таксономии, контактная информация и информация о пакете. В дополнительной таблице 1 показаны показатели охвата метаданными для всех 487 геномов FDA-ARGOS. 10 образцов полей метаданных заполнены на 100 % и доступны во всем наборе образцов с пятью рекомендуемыми дополнительными показателями метаданных, такими как географическое положение, дата сбора, болезнь хозяина, пол хозяина и возраст хозяина (https://www.ncbi.nlm. nih.gov/biosample/docs/attributes/). С точки зрения клинической представленности, 81,9% клинических образцов в коллекции связаны с известным фенотипом/заболеванием хозяина.

Решающее значение для обозначения геномов нормативного уровня для диагностического использования имел институт показателей контроля качества для всех аспектов генерации генома. Чтобы объективно определить такие показатели контроля качества, мы провели внутреннюю оценку контроля качества всех 487 сборок генома (см. раздел «Методы» для расчета статистики контроля качества сборки генома FDA-ARGOS и дополнительные данные 1). На рисунке 3 показано качество сборок генома FDA-ARGOS по сравнению с репрезентативной базой данных NCBI GenBank 2013 года и репрезентативной базой данных NCBI GenBank 2018 года. В базе данных NCBI 2013 и 2018 годов содержится до 50 сборок NCBI для каждого вида в базе данных FDA-ARGOS за соответствующий год. Что касается относительного количества сборок, то база данных NCBI 2018 года содержала 3535, а база данных 2013 года — 1617. В целом мы наблюдали более высокое качество в наборе данных генома FDA-ARGOS для показателей покрытия, N50 и L50 качества сборки по сравнению с общедоступными данными NCBI GenBank за 2013 и 2018 годы. набор геномных данных (рис. 3a–c соответственно). На рисунке 3d показано, что только 675 из 3535 геномов, собранных в NCBI GenBank за 2018 г., или 20%, продемонстрировали качество сборки, сравнительное с последовательностями генома FDA-ARGOS, при рассмотрении одного из показателей качества сборки. Что еще более важно, при рассмотрении всех показателей сборки контроля качества только 11 из 3535 собранных геномов NCBI GenBank за 2018 год, или 0,3%, показали качество, сравнимое с сборками генома FDA-ARGOS.

Рис. 3

Показатели качества эталонных геномных сборок FDA-ARGOS. Сравнительные показатели качества сборки микробного генома сравнивали текущие сборки FDA-ARGOS со сборками NCBI GenBank 2013 и 2018 годов, представленными для каждого вида, захваченного в базе данных FDA-ARGOS. Измеренные показатели качества сборки включали: ( a ) медианное покрытие, ( b ) медиану N50, ( c ) медиану L50 и ( d ) количество геномов NCBI 2018 г., которые демонстрировали все, одно или определенное качество контрольная метрика, используемая для проверки геномов FDA-ARGOS на предмет включения. Сборки NCBI были загружены 6 августа 2018 г. Для каждой прямоугольной диаграммы центральная линия представляет собой медианное значение и ограничена 25-м и 75-м процентилями. Усы представляют минимальное и максимальное значения

Полноразмерное изображение

Мы ожидаем уточнения показателей качества для статуса генома нормативного уровня (рис. 1b), поскольку мы продолжаем заполнять FDA-ARGOS дополнительными геномами с контролируемым качеством; поэтому мы установили требование, чтобы все геномы были общедоступны. Для депонирования всех геномов FDA-ARGOS требуется, чтобы необработанные чтения, собранные геномы и ассоциативные метаданные были общедоступны (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/231221) (см. https://www.fda. gov/medical-devices/science-and-research-medical-devices/database-reference-grade-microbial-sequences-fda-argos для получения дополнительной справочной информации и обновленных геномов).

Точная идентификация

E. avium

В процессе создания геномов FDA-ARGOS возникло несколько научных соображений, включая первоначальный импульс для этих усилий, заполнение пробелов диагностически ценными эталонными геномами контролируемого качества. Наш первый пример использования задокументировал важность заполнения пробелов в геноме геномами, контролируемыми FDA-ARGOS, а также влияние отсутствия высококачественных общедоступных геномов важных с медицинской точки зрения микробов на потенциальные диагностические приложения. В частности, мы проверили, повлияло ли добавление эталонных последовательностей с контролируемым качеством в общедоступные репозитории на обнаружение патогена NGS метагеномного подхода к секвенированию дробовика в имитации клинического заболевания 9. 0347 E. avium- в образце крови человека с клинически значимыми титрами. Изолят из эталонного генома SAMN04327393, который был удален из эталонных баз данных для анализа данных, использовали в качестве имитатора клинического образца E. avium . Первоначальное картирование прочтений с использованием CLC Genomics и последовательностей E. avium из общедоступных баз данных в качестве эталона продемонстрировало, что сборка de novo данных E. avium была невозможна из-за всего лишь в среднем 424,4 сопоставленных прочтений парных концов (дополнительная таблица 2). ). Для системы отсчета нам потребуется более 600 000 прочтений для новой сборки целых E. avium геном размером ~ 5 Мб при 20-кратном покрытии, при условии размера считывания 150 п.н. и идеального качества каждого сгенерированного считывания во всех позициях.

Метагеномное секвенирование из клинической матрицы привело к низкому количеству прочтений, специфичных для патогенов, и собранным de novo контигам, что потребовало диагностических вызовов из эталонного охвата <1×. Из-за этого отсутствия охвата ошибки нуклеотидов в эталонных геномах могут привести к смещению считывания и ложным срабатываниям диагностики. Чтобы проверить это утверждение, мы создали 200 независимых рандомизированных экземпляров базы данных с подвыборкой сборок NCBI Nt или FDA-ARGOS (дополнительные данные 1). Каждый экземпляр базы данных имел идентичный видовой состав микроорганизмов и количество сборок каждого вида. Видовой состав был построен на основе эмпирического пересечения сборок FDA-ARGOS и сборок NCBI Nt. Впоследствии, чтобы определить это пересечение, мы провели 1200 симуляций с помощью MegaBLAST 9.1478 24 или Kraken ²⁵ с теми же параметрами, отсечками и идентичным количеством случайно выбранных репрезентативных видовых сборок из NCBI Nt и FDA-ARGOS, а также в трех экземплярах метагеномных образцов ДНК E. avium . Нормализованные экземпляры базы данных NCBI Nt и FDA-ARGOS показали в среднем 61 чтений E. avium (минимум 18, максимум 109).

Подробное исследование всех картированных прочтений показало четкую картину влияния качества генома на точную идентификацию видов (см. Дополнительные данные 3). Из 1200 симуляций метагенома 600 симуляций были выполнены с помощью инструмента MegaBLAST и нормализованных экземпляров базы данных NCBI Nt или FDA-ARGOS (см. Дополнительные данные 4). В частности, в то время как NCBI Nt дал 190,26% общего количества картированных прочтений по сравнению с 0,007% для FDA-ARGOS (рис. 4), NCBI Nt картировал прочтений для более чем 30 различных видов, кроме патогена в этом образце, E. avium . Наибольшее количество прочтений, в среднем 34 879 прочтений, соответствовало Vibrio vulnificus по сравнению с 62 прочтениями в среднем для E. avium . Напротив, моделирование MegaBLAST с помощью FDA-ARGOS дало один вид, E. avium , со средним числом прочтений 60. Дальнейший анализ результатов, полученных с экземплярами базы данных NCBI Nt и инструментом MegaBLAST, выявил неправильно маркированные геномы из-за заражения человека. Kraken дал аналогичные результаты (см. Дополнительные данные 5).

Рис. 4

Сравнение результатов классификации показаний NCBI Nt и FDA-ARGOS. Визуализация биоинформатического анализа с помощью инструмента MegaBLAST для метагеномных дробовиков данных имитации клинического образца крови человека с добавлением 10 ⁵ E. avium . Тепловая карта показала результаты классификации чтения для трех образцов, запущенных на 200 экземплярах базы данных. Темно-синий цвет указывает на количество прочтений ниже 10. Градиент от белого к красному указывает на количество прочтений в диапазоне от более 10 до 100 000. Здесь мы продемонстрировали прочитанные результаты классификации для всех смоделированных видов. Результаты классификации E. avium были одинаковыми во всех экземплярах базы данных. Кроме того, несколько других видов были классифицированы как более 1000 прочтений с помощью нормализованных экземпляров базы данных NCBI Nt (дополнительные данные 3 и 4)

Полноразмерное изображение

при влиянии качества генома, чтобы устранить любой потенциальный искажающий эффект из матрицы образца. Мы провели 1200 изоляционных симуляций, и все они привели к стабильным 9Род 0347 Enterococcus вызывает с E. avium в качестве основного вида как для нормализованных экземпляров базы данных NCBI Nt, так и для экземпляров базы данных FDA-ARGOS. Однако несколько симуляций с нормализованной базой данных NCBI Nt показали, что Enterococcus hirae являются лучшими (дополнительные данные 6, 7 и 8). Дальнейший анализ этих результатов показал, что один конкретный геном Enterococcus hirae оказался наиболее удачным. Расчетный показатель ANI для SAMN03198084 (дополнительные данные 2) показал более высокую корреляцию с E. avium геномов, чем остальные геномов Enterococcus hirae .

Для будущего сравнительного анализа инструментов биоинформатики мы предоставили все эталонных наборов данных и баз данных E. avium (см. Раздел «Доступность данных: справочные наборы данных a и b» и «Дополнительные данные 2»).

Проверка C-RM для диагностики ID-NGS вируса Эбола как вариант использования 2

Основным стимулом для разработки FDA-ARGOS является обеспечение и продвижение инноваций для медицинских устройств ID-NGS. В процессе заполнения базы данных FDA-ARGOS созрела концепция частичной валидации in silico, а не полностью эмпирической валидации образцов клинических испытаний с помощью независимого эталонного метода золотого стандарта. Мы выбрали эталонные последовательности вируса Эбола FDA-ARGOS (дополнительные данные 1) и целевой анализ ID-NGS, зонды молекулярной инверсии вируса Эбола (MIPS), чтобы оценить применение FDA-ARGOS в качестве инструмента сравнения целевых последовательностей in silico. В таблицах 1 и 2 показаны диагностические характеристики анализа MIPS ID-NGS с образцами клинического вируса Bundibugyo и EBOV Makona, которые считаются более чувствительными, чем анализ EBOV в режиме реального времени (RT-PCR) ²⁶ . При оценке 10 клинических образцов вируса Bundibugyo и 15 клинических образцов EBOV Makona согласованные положительные результаты ПЦР в реальном времени и MIPS варьировались от 9 из 10 клинических образцов (таблица 1) до 6 из 15 (таблица 2) соответственно. Интуитивно понятно, что более низкие значения цикла количественного анализа ( C _q ) коррелируют с более высокой классификацией чтения MIPS, предполагая, что способность ID-NGS обнаруживать организмы зависела от начальной концентрации целевого геномного материала. Ложноотрицательные результаты MIPS для низких целевых аналитов предполагают, что полная валидация in silico является нереалистичным подходом для клинических испытаний без сравнения с каким-либо золотым стандартным эталонным методом, в данном случае с ПЦР в реальном времени.

Таблица 1. Сводная информация об эффективности эболавируса Bundibugyo

Полная таблица

Таблица 2. Сводная информация об эффективности эболавируса Заира Makona

Полная таблица

Постоянное соответствие между эталонным анализом RT-PCR, тестовым устройством MIPS и FDA-ARGOS in silico валидация целевой последовательности была важна для установления уверенности в рассмотрении метода сравнения in silico для определения идентификатора клинического образца. Чтобы проверить это предположение, мы использовали три инструмента классификации прочтений: MegaBLAST 9.1478 24 , Kraken ²⁵ и LMAT ²⁷ для оценки предложенного метода проверки целевой последовательности in silico (рис. 1a) и для проверки возможности использования сравнения in silico без какой-либо эмпирической проверки. Анализы MegaBLAST и Kraken необработанных данных о последовательностях для образцов вируса Bundibugyo в сочетании с FDA-ARGOS в качестве эталонной базы данных генома показали полное совпадение для вызовов MIPS и in silico (таблица 1). Поскольку при сравнении in silico пропущен вызов классификации по сравнению с эталонным тестом PCR золотого стандарта для образца с низким уровнем аналита (1 ложноотрицательный результат для проверки in silico), мы провели более глубокий анализ дополнительных образцов EBOV Makona через MegaBLAST. , Kraken и LMAT (таблица 2). Эти анализы показали результаты, аналогичные данным вируса Bundibugyo при 100% совпадении с тестовым устройством, но только для образцов с низким C _q или высокие входные концентрации целевого организма. Дополнительные анализы, сравнивающие результаты для каждой справочной базы данных инструментов биоинформатики с добавлением геномов FDA-ARGOS и без них, дали аналогичные результаты, демонстрирующие, что одних только геномов, контролируемых FDA-ARGOS, было достаточно для сравнения in silico (дополнительные данные 9). В целом, эти данные, предлагаемые для сравнения последовательностей in silico, будут полностью зависеть от присущей анализу секвенирования чувствительности для получения данных чтения последовательности, поэтому составной эталонный метод (C-RM) (сочетающий сравнение целевой последовательности in silico с репрезентативным клиническим тестированием) необходимо для полной проверки тестового устройства ID-NGS. На рисунке 1a показан C-RM, подчеркивающий необходимость эмпирической оценки подмножества образцов, специфичного для анализа ID-NGS, или четко определенных микробных эталонных материалов (MRM).

Оценка клинических образцов показала необходимость сравнения анализов ID-NGS с применяемыми в настоящее время эталонными методами, таким образом, применение C-RM. Чтобы задокументировать применение сравнительного анализа MIPS Ebola Makona ID-NGS, мы провели имитацию клинического испытания для оценки репрезентативной оценки клинических испытаний в рамках предлагаемого C-RM. Первоначально мы выполнили предварительную оценку предела обнаружения (LOD), чтобы определить объем пробной клинической оценки. Эти эксперименты показали предварительный LOD 10 ⁵ с линейной корреляцией доза-ответ к вводу EBOV при титровании (дополнительная таблица 3). Дополнительные 40 положительных повторов, выполненных в двух независимых экспериментах, подтвердили LOD на уровне 10 ⁵ БОЕ/мл для EBOV. Эта концентрация послужила основой для уровней всплесков в имитационном клиническом испытании. Из в общей сложности 148 протестированных образцов 48 представляли собой образцы с положительным ПЦР в реальном времени с пиками, 16 из которых имели высокий уровень (10 × LOD), 16 — средний (5 × LOD) и 16 — 1 × LOD для анализа MIPS (таблица 3). . Только 9из 16 образцов при 1× LOD для анализа MIPS были положительными, при этом 37 из 48 образцов оказались положительными во всем наборе образцов в этом анализе. Однако положительная прогностическая ценность (PPV) и отрицательная прогностическая ценность (NPV) для анализа MIPS составляли 97,4% и 90%, соответственно, на уровне или выше предела обнаружения с распространенностью 32,4% (таблица 4). Кроме того, в Таблице 5 перечислены положительные и отрицательные прогностические значения для предшествующих вероятностей заражения от 0 до 1. Метрики PPV и NPV являются важными инструментами прогностической аналитики, обеспечивающими характеристики эффективности диагностического теста ID-NGS в клиническом контексте. . Эти данные служат обоснованием для разработчиков, использующих частичную проверку in silico, когда уровень ложноотрицательных результатов низкий.

Таблица 3 План эксперимента и результаты имитационного клинического испытания EBOV

Полноразмерная таблица

Таблица 4 Диагностическая эффективность имитационного клинического испытания EBOV

Полноразмерная таблица

Таблица 5 Для будущего сравнительного анализа инструментов биоинформатики мы предоставили все справочные наборы данных и базы данных по Эболе (см. раздел «Доступность данных: справочные наборы данных c–e» и «Дополнительные данные 1»).
Обсуждение
В целях поощрения инноваций в сообществе инфекционистов мы предоставляем обоснование и показатели качества для эталонной базы данных генома FDA-ARGOS и демонстрируем полезность базы данных FDA-ARGOS на примере двух вариантов использования.
Важнейшим аспектом оценки эффективности любой диагностики является доступность минимальных показателей контроля качества данных, геномных или иных, для проверки. Здесь определены критерии генома FDA-ARGOS нормативного уровня, которые предоставляют разработчикам диагностических тестов ID-NGS и научному сообществу отслеживаемые и контролируемые по качеству эталонные геномы для диагностического использования. Эти высококачественные геномы в сочетании с рациональным подходом к всестороннему расширению FDA-ARGOS за пределы первоначальных 2000 геномов необходимы для продолжения разработки диагностических тестов ID-NGS.
Секвенирование генома и исследования FDA-ARGOS привели к шести широким показателям качества (рис. 1b), определяющим критерии генома нормативного уровня, необходимые для нынешних и будущих участников FDA-ARGOS. Все существующие геномы в базе данных FDA-ARGOS (дополнительные данные 1) соответствуют показателю качества 95% охвата с 20-кратной глубиной в каждой позиции во всем собранном геноме. Эта метрика применяется к первоначальному депонированию как минимум пяти геномов любого рода/вида, добавленных в FDA-ARGOS. Эти пять геномов определяют основной геном FDA-ARGOS. После того, как в базе данных появятся пять или более геномов нормативного уровня для каждого рода/вида, мы рассмотрим более низкие пороговые показатели для включения FDA-ARGOS, чтобы зафиксировать уникальные геномы, которые могут быть диагностически информативными.
В идеале эталонная модель генома должна обеспечивать 100% охват генома с бесконечной глубиной охвата всей потенциальной информации на геномном уровне. Этот идеал также будет охватывать дополнительные слои информации, такие как пластичность генома (например, все вариации генома) и сходство со всеми ближайшими соседями. Это недостижимо с современными технологиями и без бесконечного всестороннего отбора проб рассматриваемых организмов; однако эталонные геномы, прошедшие контроль качества FDA-ARGOS, представляют собой шаг в этом направлении. Принимая во внимание антропогенные и технологические ошибки и изучая видоспецифичные и близкие вариации генома, FDA-ARGOS начинает процесс предоставления эталонных геномов контролируемого качества для диагностики соответствующих микробов. В настоящее время мы считаем пороги равными 95% охвата и 20-кратной глубины достаточно для применения этих геномов в диагностических целях в рамках ограниченных вариантов использования. Дополнительная метрика, состоящая как минимум из пяти репрезентативных геномов, пытается отразить первоначальное понимание генетической изменчивости внутри организма, а не полагаться на консенсусную последовательность штамма определенного типа. Понятно, что пяти репрезентативных геномов недостаточно для многих организмов, чтобы полностью охарактеризовать пангеном и понять все генетические вариации внутри вида. Гипотетически существует видоспецифичное количество геномов, которые могут определять объемную геномную информацию о микробе. Будущие усилия, направленные на базы данных по конкретным видам, потребуются для определения вида, определяющего количество геномов для надежного учета видового разнообразия. Таким образом, эти требования могут измениться в будущем по мере открытия организмов и появления технологий.
Мы работаем над методами включения дополнительных высококачественных эталонных геномов посредством процесса квалификации с использованием характеристик эталонного генома FDA-ARGOS. В частности, мы оцениваем качество генома (например, покрытие, ANI, содержание GC, размер сборки), непрерывность генома (например, N50, L50, количество контигов), таксономию и метаданные (например, название вида, источник выделения, отправитель, ортогональный эталонный метод) метрики, позволяющие сообществу квалифицировать геномы для депонирования ARGOS. Эти усилия будут применять перечисленные выше показатели к существующей общедоступной геномной информации в сочетании с методами машинного обучения и искусственным интеллектом для предоставления информации внешнему инструменту квалификации генома, что значительно расширит полезность базы данных FDA-ARGOS.
Отсутствие эталонных геномов с контролируемым качеством ставит под угрозу точность основанного на эталонах выравнивания ID-NGS для запрашиваемых микробных патогенов. Вариант использования 1 подчеркивает текущие проблемы с технологией NGS для инфекционных заболеваний при использовании минимальных, некурируемых или отсутствующих эталонных баз данных, что может привести к отсутствию диагностического вызова или даже к неправильной диагностике. Эти данные были подчеркнуты двумя ключевыми выводами: (1) сборка данных последовательностей de novo была невозможна из-за небольшого количества прочтений в клинической матрице и (2) различное качество микробных эталонных геномов в общедоступных базах данных затрудняло идентификацию метагеномных образцов. почти невозможно (дополнительные данные 3, 4, 5). Последний пункт чрезвычайно важен для целей ID-NGS для диагностических приложений. В представленном здесь случае верхняя микробная последовательность не соответствовала интересующему микробу из-за отсутствия контроля качества в справочной базе данных NCBI Nt. Интуитивно понятно, что использование геномов FDA-ARGOS, прошедших контроль качества, решило эту проблему. Некоторый уровень загрязнения ожидается, однако результаты моделирования с нормализованными базами данных NCBI Nt указывают на необходимость более строгого контроля качества, включая скрининг микробных эталонных баз данных на предмет загрязнения людьми и лабораториями, для основанных на эталонах приложений выравнивания ID-NGS, особенно для диагностическое использование. Кроме того, Результаты секвенирования изолята E. avium показали зависимость как алгоритма классификации (например, MegaBLAST и Kraken), так и используемой базы данных (дополнительные данные 6, 7, 8). Этот последний аспект варианта использования E. avium стал основой для рассмотрения C-RM и открыл возможность использования набора проверенных инструментов биоинформатики для проверки целевой последовательности in silico. Кроме того, эти результаты ясно продемонстрировали необходимость всесторонних сравнительных исследований гражданской науки для изучения влияния различных алгоритмов и критериев классификации. PrecisionFDA CDRH Biothreat Challenge решает эту проблему. Более подробная информация о вызове доступна здесь (https://precision.fda.gov/challenges/3) и в блоге экспертов (https://precision.fda.gov/experts/6/blog).
В отношении геномной информации и ID-NGS распространены две основные противоположные философии: (1) вся информация, независимо от качества, полезна для постановки диагноза, чем больше данных, тем лучше, при этом предполагается, что диагноз основан на исправлении ошибок. через итерацию, или (2) в качестве прочной основы требуются тщательно отобранные геномы с контролируемым качеством, чем больше информации, тем лучше, однако для диагностики требуются геномы с контролируемым качеством для информирования основы диагноза. Представленные здесь эксперименты и данные подтверждают последний из этих двух аргументов. В частности, пока Эталонные геномы E. avium были доступны в нормализованных экземплярах базы данных NCBI Nt, для положительной идентификации ID-NGS E. avium в метагеномном образце требовались эталонные геномы FDA-ARGOS с контролируемым качеством.
Более 2 % симуляций с помощью MegaBLAST и NCBI Nt выявили ошибочно помеченный E. hirae как наиболее подходящий для данных по изоляту E. avium , что потенциально может привести к ложноположительным вызовам идентификации видов, если эта база данных будет использоваться. Потенциальным решением этой проблемы может быть применение аналогичных показателей контроля качества, которые используются для включения эталонного генома FDA-ARGOS. Мы полностью поддерживаем использование NCBI Nt в качестве справочной базы данных, но с соответствующими элементами управления. Создание FDA-ARGOS в рамках NCBI предоставляет дополнительный ресурс, специально предназначенный для диагностических целей. В дополнение к рассмотрению некоторых из этих элементов управления, наша основная цель для эталонных геномов FDA-ARGOS состоит в том, чтобы предоставить инструмент, позволяющий проводить валидацию in silico и продвигать инновации. В этом контексте можно использовать NCBI Nt; тем не менее, с пониманием того, что это может повлиять на производительность последующей диагностики.
Качество и охват целевых организмов являются критическими аспектами перехода ID-NGS в клиническое пространство; однако, чтобы способствовать переходу, необходимы методы, облегчающие проверку ID-NGS на все запрашиваемые патогены. В этой рукописи описаны методы использования эталонных геномов FDA-ARGOS, прошедших контроль качества, для сравнения целевых последовательностей in silico в рамках предлагаемого C-RM. Мы показали здесь, что проверка in silico эболавирусов Bundibugyo и Zaire может использовать геномы FDA-ARGOS в качестве компаратора. Для MIPS-положительных образцов наблюдалось 100% соответствие между золотым стандартом для сравнения ПЦР в реальном времени и сравнением целевой последовательности in silico. Это поддерживает возможность реализации этой стратегии для сокращения будущих клинических оценочных исследований на основе NGS. Однако ПЦР в реальном времени была более чувствительна, чем анализ MIPS NGS, особенно при высоких C _q значений. Потенциальным решением этой проблемы является применение дополнительных стратегий обогащения, чтобы довести ID-NGS до чувствительности, аналогичной золотому стандарту ^28,29 . Однако в текущей форме наблюдаемая более низкая чувствительность анализа MIPS по сравнению с ПЦР в реальном времени указывает на необходимость C-RM и включения дополнительных эмпирических исследований, т. как часть клинической валидации. Противоречивые результаты на высоких C _q значения подчеркивают опасность применения только сравнения целевой последовательности in silico. Без какой-либо эмпирической оценки сравнение in silico давало бы результаты только в пределах диапазона чувствительности тестового устройства ID-NGS, не предоставляя необходимого эталона чувствительности по сравнению с золотым стандартом, таким как ПЦР в реальном времени. Поэтому в рамках C-RM мы демонстрируем предварительную оценку производительности по сравнению с золотым стандартом для подмножества образцов клинических испытаний с намерением, чтобы оставшаяся часть образцов клинических испытаний могла быть подтверждена путем сравнения последовательностей in silico. Для достижения желаемой эффективности идентификации различных организмов может потребоваться различная глубина считывания образца. Разработчикам тестов может потребоваться использовать внешний компаратор только для результатов проверки in silico, когда тестовое устройство и сравнение in silico дали противоречивый результат. Потенциальными ограничениями подхода C-RM могут быть (1) случаи, когда тестирование ортогонального эталонного метода невозможно, или (2) недоступны подходящие эталонные геномы. Стратегии смягчения последствий включают потенциальное использование других достоверных научных данных для ортогонального тестирования и представление эталонных геномов в FDA-ARGOS для квалификации и включения. Мы предполагаем, что этот C-RM станет основным инструментом базы данных генома FDA-ARGOS для разработки медицинских устройств. Мы надеемся, что FDA-ARGOS будет стимулировать инновации и ускорять нормативную науку и, в конечном итоге, позволит ID-NGS в качестве диагностического средства войти в клинику.
Ресурс эталонного генома FDA-ARGOS представляет собой постоянно развивающуюся общедоступную базу данных, предназначенную для усовершенствования с течением времени при поддержке сообщества и достижениях в области геномных технологий. Для охвата множества инфекционных микроорганизмов потребуются постоянная популяция и расширение ресурса базы данных FDA-ARGOS. Необходимость полного охвата генома нормативного уровня очевидна, однако ни одна организация не может выполнить все необходимое секвенирование. Поэтому мы работаем над возможностью внешней квалификации генома, чтобы упростить и расширить ресурсы FDA-ARGOS по мере необходимости. В центре внимания будущих исследований будут как внешняя квалификация генома, так и продолжение исследований по применению этого стандарта нормативного уровня к некультивируемым и новым патогенам.
Дальнейшее заполнение и курирование базы данных поддержит успех FDA-ARGOS и будет способствовать принятию сообществом NGS. Команда FDA ищет уникальные, труднодоступные микробы, такие как биологически опасные организмы, новые патогены и патогены, связанные с УПП, чтобы помочь улучшить базу данных. Мы призываем сообщество делиться образцами микробов здесь (https://argos.igs.umaryland.edu/).
Методы
Депонирование генома из базы данных FDA-ARGOS
Используя ранее идентифицированный микроб(ы), нуклеиновая кислота была извлечена для подготовки библиотеки и секвенирования. Затем микробные нуклеиновые кислоты секвенируются и собираются de novo с использованием платформ секвенирования Illumina и Pac Bio в Институте геномных наук Университета Мэриленда (UMD-IGS). Качество собранных геномов контролировалось рабочей группой экспертов по предмету ID-NGS, состоящей из сотрудников FDA и сотрудников, при этом все передаваемые данные депонировались в базах данных NCBI. Перейдите по этой ссылке (https://www.fda.gov/medical-devices/science-and-research-medical-devices/database-reference-grade-microbial-sequences-fda-argos) для полной информации, сотрудников и FDA- Статус генома ARGOS. В дополнительных данных 1 перечислены все геномы FDA-ARGOS с поступлениями и статистическими данными, использованными в этой рукописи.
Секвенирование и сборка эталонного бактериального генома
Подход к гибридному секвенированию ²², основанный на технологии длинного и короткого считывания NGS, был выбран с использованием технологий Illumina и PacBio NGS для создания высококачественных последовательностей бактериального генома. Для обеих технологий требовалось достаточное количество исходного геномного материала с высокой молекулярной массой. Наборы бактериальных библиотек мультиплексировали на Illumina PE HiSeq4000 с использованием протокола парных концов 150 bp с 24–48 изолятами на дорожку. Порог охвата был установлен на уровне 300×, чтобы гарантировать достижение достаточной глубины считывания с помощью технологии короткого считывания NGS для создания высококачественной сборки. Кроме того, на PacBio RS II P6-C4 были запущены наборы бактериальных библиотек, по крайней мере, с одной ячейкой SMRT на бактериальный геном. Порог охвата был установлен на уровне 100×, чтобы гарантировать достижение достаточной и экономически целесообразной глубины считывания с помощью технологии длительного чтения NGS для создания высококачественной сборки. Данные собирались как по отдельности, так и в комбинации с использованием ряда инструментов сборки, включая SPAdes 9.1478 30 , Canu ³¹, HGAP ³² и Celera Assembler ³³. Для полировки данных использовался Pilon ³⁴. Ручное курирование было выполнено для достижения оптимальной сборки и достижения консенсуса.
Секвенирование и сборка эталонного вирусного генома
Секвенирование вирусного генома включало дробовик, ампликон и необязательные методы секвенирования 5’/3′ RACE для создания полноразмерных последовательностей вирусного генома. Для всех трех подходов требовалось достаточное количество высококачественного исходного геномного материала. Секвенирование ампликона с 48–96 перекрывающихся ампликонов использовали для создания глубокого охвата известных областей генома и использовали для оценки квазивидов в каждом изоляте. Быстрая амплификация концов кДНК (RACE) использовалась, когда желательно было закончить 5′- и 3′-концы, а метод дробовика генерировал данные по всем РНК, присутствующим в образце, без уровня систематической ошибки, присутствующей в подходе ампликона. Наборы вирусных библиотек из всех трех подходов мультиплексировали на Illumina MiSeq с использованием протокола парных концов 300 п.н. Порог покрытия был установлен на уровне 100×, чтобы обеспечить двукратное покрытие ампликоном всего генома. Дробовик, ампликон и данные RACE были собраны как по отдельности, так и в комбинации с использованием ряда сборочных инструментов, включая SPAdes 9.1478 30 и Celera Assembler ³³ . Ручное курирование было выполнено для достижения оптимальной сборки и достижения консенсуса.
Статистика контроля качества сборки генома FDA-ARGOS
Статистика охвата была рассчитана для каждой сборки генома FDA-ARGOS. Покрытие Illumina и покрытие PacBio рассчитывались отдельно. Короткие чтения Illumina сначала были сопоставлены с консенсусной последовательностью сборки с использованием Bowtie2 ³⁵ . Затем покрытие Illumina было рассчитано с помощью samtools 9.1478 36 в полученном файле sam. Прочтения PacBio были выровнены по согласованной последовательности сборки с использованием BLASR ³⁷ . Затем было рассчитано покрытие PacBio с помощью samtools ³⁶ на полученном файле sam. Общее покрытие рассчитывали путем сложения покрытия PacBio и покрытия Illumina в каждой позиции пары оснований в консенсусной последовательности сборки.
Аннотации геномов FDA-ARGOS
Геномы были аннотированы с помощью инструментов аннотирования NCBI для оптимизации процесса ^{38,39,40,41,42} . Бактериальные последовательности были аннотированы с помощью конвейера аннотации генома прокариот (PGAP) NCBI, который сочетает в себе алгоритмов предсказания генов ab initio с методами, основанными на гомологии. Вирусные последовательности были сопоставлены с их наиболее похожими NCBI RefSeqs (NC_002549, NC_014372, NC_006432, NC_014373, NC_004162, NC_004161, NC_003899, NC_001449, NC_001544, NC_035889) с использованием инструмента выравнивания Geneious 4,7, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4. Использовалась настройка автоматического определения обнаружения, а остальные параметры были установлены по умолчанию. Аннотации генов, CDS и зрелых пептидов из RefSeq были перенесены в последовательности, начальные и конечные положения были проверены на предмет гомологии, а последовательности были вручную проверены на наличие неожиданных стоп-кодонов или областей с высокой степенью несходства. Аннотации используемых RefSeq были проверены кураторами NCBI на основе доступной литературы, и в некоторых случаях аннотации были выполнены в сотрудничестве с исследователями, знакомыми с вирусами.
Сбор и подготовка клинических образцов
Клинические и имитационные клинические испытания образцов были проведены для демонстрации полезности FDA-ARGOS. Из Демократической Республики Конго (ДРК) были получены десять деидентифицированных образцов сыворотки крови человека, подозреваемых в положительном результате на вирус Бундибуджио. Эти образцы были определены Управлением USAMRIID по использованию человека и этике как не подлежащие исследованию на людях (HP-12–15). Присутствие вируса в образцах человека определяли с помощью ранее разработанного анализа ОТ-ПЦР в реальном времени на вирус Bundibugyo ²⁶ . Образцы анализировали в двух повторностях с использованием 5 мкл очищенной РНК на LightCycler 480 (Roche Diagnostics Corporation). Положительный образец был определен как имеющий значение цикла количественного анализа ( C _q) < 40 циклов (таблица 1).
Пятнадцать деидентифицированных образцов сыворотки крови человека, положительных на вирус Эбола (EBOV) Makona, были получены из Сьерра-Леоне; эти образцы были определены Управлением USAMRIID по использованию человека и этике как не подлежащие исследованию на людях (HP-09-32). Все образцы были собраны и деидентифицированы в Сьерра-Леоне в государственной больнице Кенемы, и при получении образцы имели косвенные идентификаторы. Присутствие вируса в образцах человека определяли с помощью ранее разработанного анализа RT-PCR в реальном времени ²⁶ . Образцы анализировали в двух повторностях с использованием 5 мкл очищенной РНК на LightCycler 480 (Roche Diagnostics Corporation). Положительный образец был определен как имеющий значение цикла количественного анализа ( C _q) < 40 циклов с дублированием положительных результатов ПЦР в реальном времени (таблица 2).
Для этого исследования использовался один клинический штамм E. avium из детской больницы, который поддерживался в USAMRIID через систему унифицированной коллекции культур (UCC). После ночного роста E. avium (~ 16 часов) была выбрана одна изолированная колония, которую инокулировали в триптический соевый бульон (ThermoFisher, Waltham, MA). Из ночной культуры готовили глицериновый раствор и одновременно проводили подсчет колоний для определения КОЕ/мл исходного организма.
Метагеномное секвенирование и секвенирование дробовика
Образец E. avium SAMN04327393 культивировали на чашках с кровяным агаром или в трипсино-соевом бульоне (ThermoFisher, Waltham, MA). Образцы добавляли до конечной концентрации 10 ⁵ КОЕ/мл в воде или матрице цельной крови (BioreclamationIVT, Балтимор, Мэриленд) и 100 мкл экстрагировали с использованием вирусного набора Qiagen EZ1 (Qiagen, Валенсия, Калифорния) в соответствии с инструкцией производителя. инструкции. Концентрацию ДНК определяли количественно с использованием набора для анализа Qubit dsDNA BR (ThermoFisher). Образцы ДНК были подготовлены для секвенирования на платформе MiSeq с использованием набора для подготовки библиотеки ДНК Nextera XT в соответствии с инструкциями производителя (Illumina, Сан-Диего, Калифорния). Препараты библиотеки количественно определяли и нормализовали с использованием набора для количественного определения библиотеки KAPA (Kapa Biosystems, Уилмингтон, Массачусетс) и секвенировали на платформе MiSeq с использованием набора для секвенирования 2 × 150 циклов (Illumina). Прочтения секвенирования анализировали с использованием CLC Genomic Workbench (CLC Bio, Кембридж, Массачусетс). Для метагеномного анализа чтения парных концов были обрезаны на CLC с использованием модифицированного алгоритма обрезки Мотта с использованием обрезки качества 0,05, а чтения длиной менее 50 п.н. были удалены из дальнейшего анализа. Показатели качества в CLC находятся по шкале Phred, а показатели качества Phred ( Q ) определяются как Q = −10log10( P ), где P — базовая вероятность ошибки при вызове. Затем обрезанные чтения были сопоставлены с сборкой E. avium GCF_000407245.1 и сборкой H. sapiens GCA_000001405.27 с использованием CLC genomics workbench v 10.1.1. Параметры сопоставления были следующими: стоимость несоответствия = 2, стоимость вставки = 3, стоимость удаления = 3, доля длины и сходства = 0,8.
Целевое секвенирование зонда с молекулярной инверсией (MIPS)
Образцы клинических данных вируса Bundibugyo (BDBV) и вируса Эбола (EBOV) Makona анализировали с использованием подхода MIPS ⁴⁴ для захвата целевой последовательности в кольцевой олигонуклеотид. Реакция ПЦР и последующая NGS на Illumina MiSeq (2 × 150) амплифицировали и идентифицировали захваченную последовательность с использованием CLC genomics workbench (CLC Bio, Кембридж, Массачусетс), картирование считывания обратно в эталонный геном (EBOV (GenBank # NC_002549), BDBV ( GenBank # NC_014373). Положительный вызов определялся для каждого образца как любой эталон, который имел общее количество показаний секвенирования выше порогового значения, определяемого как среднее плюс трехкратное стандартное отклонение трех независимых контрольных образцов без шаблона. как сообщалось о вирусе Bundibugyo или EBOV Makona.Для подхода MIPS оставшиеся чтения являются неспецифическими или фоновыми.
Пробная клиническая диагностическая оценка
Диагностическая эффективность анализа MIPS оценивалась на 148 слепых образцах. Предел обнаружения (LOD) определяли посредством предварительного титрования EBOV Zaire в TRIzol, начиная с 10 ⁸ бляшкообразующих единиц (БОЕ)/мл до 10 ² бОЕ/мл, а затем запускали в трех повторностях. Концентрация, при которой все три повторения дали положительные результаты, была подтверждена как LOD в 40 повторах при этой концентрации. EBOV (Kikwit R4317a) в TRIzol LS разбавляли до 10 × (1,0E + 06 БОЕ/мл), 5 × (5,0E + 05 БОЕ/мл) и 1 × (1,0E + 05 БОЕ/мл) LOD в трех повторностях. в матрице, также содержащей TRIzol LS. Нуклеиновую кислоту экстрагировали, используя 400 мкл каждого образца вместе с 14 отрицательными образцами сыворотки, на наборе EZ1 Virus 2.0 и элюировали 60 мкл. Присутствие вируса определяли с помощью установленного метода ПЦР в реальном времени в трех повторностях для каждого извлеченного образца. Экстрагированную РНК амплифицировали из 5 мкл общей нуклеиновой кислоты с использованием набора для амплификации цельного транскриптома Quantitect (Qiagen) и количественно определяли с помощью набора Qubit dsDNA Broad Range Assay Kit. Всего в протокол MIP было добавлено 50 нг кДНК. Подготовку библиотеки проводили на приборе Apollo с использованием набора ДНК PrepX Complete ILMN 32i и двойных индексов Illumina TruSeq. Для имитации клинической оценки 48 положительных и 100 отрицательных (только матрица) образцов были секвенированы на приборе Illumina MiSeq с использованием набора для 300 циклов. Шестнадцать положительных образцов были добавлены при 10 ×, 5× и 1× LOD. Пороговые значения для положительных образцов составляли 2-кратное отношение сигнал/шум (SNR). Вся статистика эффективности диагностики была рассчитана на https://www.medcalc.org/calc/diagnostic_test.php.
Обработка коротких чтений и построение базы данных
Качество коротких чтений было проверено с помощью FastQC. Качественной обрезки не проводилось. Мы выбрали 1 000 000 коротких прочтений случайным образом из каждой выборки. 200 экземпляров базы данных были созданы путем случайной выборки сборок NCBI GenBank и сборок FDA-ARGOS (дополнительные данные 2, SAMN04327393 были исключены из построения эталонной базы данных для тематических исследований, поскольку этот геном был разработан из того же изолята, который использовался в качестве шипа -в материале для варианта использования 1). Каждый экземпляр базы данных имеет одинаковый состав видов и одинаковое количество сборок для каждого вида. Точный видовой состав сборочных наборов определяли путем нахождения пересечения сборок FDA-ARGOS и сборок GenBank.
Классификация кратких чтений
Функция MegaBLAST blast + 2.7.1, установленная на инфраструктуре FDA HPC (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK153387/), использовалась для таксономической классификации кратких чтений с использованием параметры по умолчанию и наборы сборок из 200 экземпляров базы данных. Каждый из 200 наборов сборок экземпляров базы данных был преобразован в базу данных нуклеотидов с помощью команды makeblastdb. Для этого исследования таксон, связанный с первым зарегистрированным выравниванием, отсортированный по максимальной оценке выравнивания, использовался в качестве таксономической метки для каждого чтения. Первоначальные результаты MegaBLAST были обобщены, чтобы сообщить о количестве прочтений, связанных с каждым уникальным идентификатором таксономии NCBI.
Kraken 1.0, установленный в инфраструктуре FDA HPC (https://ccb.jhu.edu/software/kraken/MANUAL.html), использовался для присвоения таксономической метки каждому короткому чтению с использованием параметров по умолчанию и того же экземпляра базы данных 200. монтажные наборы. Наборы сборок экземпляров базы данных были встроены в базы данных Kraken с использованием параметров по умолчанию. Первоначальные результаты Kraken были суммированы, чтобы сообщить о количестве прочтений, связанных с каждым уникальным идентификатором таксономии NCBI.
LMAT версии 1.2.6 (доступна для загрузки на сайте sourceforge.net/lmat), установленной в Ливерморской национальной лаборатории Лоуренса (LLNL) Инфраструктура высокопроизводительных вычислений использовалась для присвоения таксономической метки каждому короткому прочтению с минимальной настройкой оценки 0,5. Оценки соответствия рассчитываются для каждого чтения путем подгонки случайной нулевой модели, созданной путем моделирования 1 ГБ случайной последовательности для каждой модели в зависимости от длины чтения и содержимого GC. Были использованы три базы данных: стандартная база данных алгоритмов (LMAT DB), автономная FDA-ARGOS и агрегированная база данных, состоящая как из базы данных LMAT DB, так и из автономной базы данных FDA-ARGOS. Результаты LMAT были обобщены, чтобы сообщить о количестве прочтений, связанных с каждым уникальным идентификатором таксономии NCBI.
Сводка отчета
Дополнительную информацию о дизайне исследования можно найти в Сводке отчета об исследовании природы, связанной с этой статьей.
Доступность данных
Все исходные данные генома FDA-ARGOS, сборки, аннотации, метаданные, данные базовой модификации и информация о конвейере доступны в Bioproject ID # PRJNA231221 и на https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ биопроект/231221. Пять эталонных наборов данных из вариантов использования доступны в Bioproject ID# PRJNA49.5928 и на https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/495928:
• Метагеномное дробовое секвенирование для идентификации E. avium (три повторных образца).
• Секвенирование изолированного дробовика для идентификации E. avium (три повторных образца).
• MIPS для идентификации вируса Bundibugyo (10 положительных результатов ПЦР, 1 NTC).
• MIPS для идентификации вируса Эбола Makona (15 положительных результатов ПЦР, 1 NTC).
• Имитационные клинические испытания MIPS EBOV (148 слепых образцов: 48 положительных: 16 10 × LOD, 5 × LOD, 1× LOD и 100 только матричных отрицательных).
Все остальные данные содержатся в этой статье и ее дополнительной информации или могут быть получены от соответствующего автора по обоснованному запросу.
Ссылки
Wilson, M. R. et al. Острый менингоэнцефалит, вызванный вирусом Западного Нила, диагностирован с помощью метагеномного глубокого секвенирования спинномозговой жидкости у пациента с почечным трансплантатом. утра. Дж. Трансплантат. 17 , 803–808 (2017).
КАС Статья Google ученый
Schlaberg, R. et al. Валидация метагеномных тестов секвенирования следующего поколения для универсального обнаружения патогенов. Арх. Патол. лаборатория Мед. https://doi.org/10.5858/arpa.2016-0539-RA (2017).
КАС Статья Google ученый
Сниткин Е.С. и др. Интегрированные геномные данные и данные о перемещении пациентов между учреждениями позволяют выявить пути передачи мультирезистентной клебсиеллы пневмонии в региональной вспышке. Науч. Перевод Мед . 9 , https://doi.org/10.1126/scitranslmed.aan0093 (2017).
Артикул Google ученый
Сниткин Е.С. и др. Отслеживание госпитальной вспышки резистентной к карбапенемам Klebsiella pneumoniae с помощью полногеномного секвенирования. науч. Перевод Мед. 4 , 148ra116 (2012).
Артикул Google ученый
Роуч, Д. Дж. и др. Год инфекции в отделении интенсивной терапии: проспективное полногеномное секвенирование бактериальных клинических изолятов выявило скрытую передачу и новую микробиоту. Генетика PLoS. 11 , e1005413 (2015).
Артикул Google ученый
Чеснокова В. и др. Прогностическая диагностика инфекций Escherichia coli на основе клональной ассоциации устойчивости к противомикробным препаратам и клинического исхода. Дж. Клин. микробиол. 51 , 2991–2999 (2013).
КАС Статья Google ученый
Стефан С.П., Келер Дж.В. и Миноуг Т.Д. Целевое секвенирование следующего поколения для обнаружения маркеров устойчивости к ципрофлоксацину с использованием молекулярных инверсионных зондов. науч. Респ. 6 , 25904 (2016).
ОБЪЯВЛЕНИЕ КАС Статья Google ученый
Wilson, M. R. et al. Эффективная диагностика нейролептоспироза с помощью секвенирования нового поколения. Н. англ. Дж. Мед. 370 , 2408–2417 (2014).
Артикул Google ученый
Арнольд, К. Исходный код: Проверка метагеномики в клинике. Нац. Мед. 23 , 645–648 (2017).
КАС Статья Google ученый
«>
Голдберг Б., Зихтиг Х., Гейер К., Ледебур Н. и Вайншток Г. М. Переход от исследовательской лаборатории к клинике: проблемы и возможности для секвенирования нового поколения в диагностике инфекционных заболеваний. mBio 6 , e01888–01815 (2015).
КАС Статья Google ученый
Heger, M. FDA обдумывает рекомендации по диагностике инфекционных заболеваний на основе NGS. ГеномВеб (2018).
Afshinnekoo, E. et al. Геопространственное разрешение человеческого и бактериального разнообразия с помощью метагеномики в масштабе города. Сотовая система. 1 , 72–87 (2015).
КАС Статья Google ученый
Afshinnekoo, E. et al. Геопространственное разрешение человеческого и бактериального разнообразия с помощью метагеномики в масштабе города. Сотовая система. 1 , 97–97 e93 (2015).
КАС Статья Google ученый
Greninger, A.L. et al. Клиническая метагеномная идентификация энцефалита Balamuthia mandrillaris и сборка проекта генома: продолжающийся случай секвенирования эталонного генома. Геном Мед. 7 , 113 (2015).
Артикул Google ученый
Naccache, S. N. et al. Диагностика нейроинвазивной астровирусной инфекции у взрослого с ослабленным иммунитетом, страдающего энцефалитом, с помощью беспристрастного секвенирования нового поколения. клин. Заразить. Дис. 60 , 919–923 (2015).
Артикул Google ученый
Сомасекар, С. и др. Наблюдение за вирусами в образцах сыворотки пациентов с острой печеночной недостаточностью с помощью метагеномного секвенирования нового поколения. клин. Заразить. Дис. https://doi.org/10.1093/cid/cix596, (2017).
КАС Статья Google ученый
Симнер, П. Дж., Миллер, С. и Кэрролл, К. С. Понимание перспектив и препятствий метагеномного секвенирования следующего поколения в качестве диагностического инструмента для инфекционных заболеваний. клин. Заразить. Дис. , https://doi.org/10.1093/cid/cix881 (2017).
Артикул Google ученый
Гаргис А. С., Калман Л. и Любин И. М. Обеспечение качества секвенирования нового поколения в лабораториях клинической микробиологии и общественного здравоохранения. Дж. Клин. микробиол. 54 , 2857–2865 (2016).
Артикул Google ученый
Лэнд, М. и др. Идеи секвенирования бактериального генома за 20 лет. Функц. интегр. Геном. 15 , 141–161 (2015).
КАС Статья Google ученый
Land, M.L. et al. Показатели качества для 32 000 геномов. Подставка. Геном. науч. 9 , 20 (2014).
Артикул Google ученый
Schatz, M.C. & Langmead, B. Поток данных ДНК: быстрые и эффективные машины для секвенирования генома выдают больше данных, чем генетики могут проанализировать. IEEE Спектр. 50 , 26–33 (2013).
Артикул Google ученый
Корен, С. и др. Гибридная коррекция ошибок и сборка de novo считываний секвенирования одной молекулы. Нац. Биотехнолог. 30 , 693–700 (2012).
КАС Статья Google ученый
Чуфо, С. и др. Использование средней идентичности нуклеотидов для улучшения таксономических отнесений в геномах прокариот в NCBI. Междунар. Дж. Сист. Эвол. микробиол. 68 , 2386–2392 (2018).
Артикул Google ученый
Моргулис, А. и др. Индексирование базы данных для производственного поиска MegaBLAST. Биоинформатика 24 , 1757–1764 (2008).
КАС Статья Google ученый
Вуд, Д. Э. и Зальцберг, С. Л. Кракен: сверхбыстрая классификация метагеномных последовательностей с использованием точного выравнивания. Геном Биол. 15 , Р46 (2014).
Артикул Google ученый
Trombley, A. R. et al. Комплексная панель анализов полимеразной цепной реакции TaqMan в режиме реального времени для обнаружения и абсолютного количественного определения филовирусов, аренавирусов и хантавирусов Нового Света. утра. Дж. Троп. Мед. Гиг. 82 , 954–960 (2010).
КАС Статья Google ученый
Ames, S.K. et al. Масштабируемая классификация метагеномной таксономии с использованием эталонной базы данных генома. Биоинформатика 29 , 2253–2260 (2013).
КАС Статья Google ученый
O’Flaherty, B.M. et al. Всестороннее обогащение вирусов обеспечивает идентификацию и анализ генома чувствительного респираторного вируса с помощью секвенирования нового поколения. Рез. генома. 28 , 869–877 (2018).
Артикул Google ученый
Briese, T. et al. Секвенирование захвата вирома обеспечивает точную диагностику вируса и всесторонний анализ вирома. mBio 6 , e01491–01415 (2015).
КАС Статья Google ученый
«>
Банкевич А. и др. SPAdes: новый алгоритм сборки генома и его приложения для секвенирования отдельных клеток. Дж. Вычисл. биол. 19 , 455–477 (2012).
MathSciNet КАС Статья Google ученый
Корен, С. и др. Canu: масштабируемая и точная сборка с длительным чтением с помощью адаптивного взвешивания k-меров и разделения повторов. Рез. генома. 27 , 722–736 (2017).
КАС Статья Google ученый
Чин, К. С. и др. Негибридные, готовые сборки микробного генома из давно прочитанных данных секвенирования SMRT. Нац. Методы 10 , 563–569 (2013).
КАС Статья Google ученый
Берлин, К. и др. Сборка больших геномов с помощью секвенирования одной молекулы и хеширования с учетом местоположения. Нац. Биотехнолог. 33 , 623–630 (2015).
КАС Статья Google ученый
Walker, B.J. et al. Pilon: интегрированный инструмент для комплексного обнаружения микробных вариантов и улучшения сборки генома. PLoS One 9 , e112963 (2014 г.).
ОБЪЯВЛЕНИЕ Статья Google ученый
Лэнгдон, В. Б. Производительность оптимизированного генетического программирования Bowtie2 в тестах сравнения генома и аналитического тестирования (GCAT). Биоданные мин. 8 , 1 (2015).
MathSciNet КАС Статья Google ученый
Ли, Х. и др. Формат выравнивания/карты последовательностей и SAMtools. Биоинформатика 25 , 2078–2079 (2009).
Артикул Google ученый
«>
Чейссон, М. Дж. и Теслер, Г. Картирование считываний последовательности одиночных молекул с использованием базового локального выравнивания с последовательным уточнением (BLASR): применение и теория. БМС Биоинформа. 13 , 238 (2012).
КАС Статья Google ученый
Климке В. и др. Решение проблемы: стандарты аннотаций генома перед потоком данных. Подставка. Геном. науч. 5 , 168–193 (2011).
КАС Статья Google ученый
Brister, J. R. et al. О стандартах аннотации вирусного генома, отчет с семинара NCBI по аннотации 2010 г. Вирусы 2 , 2258–2268 (2010 г.).
Артикул Google ученый
Angiuoli, S.V. et al. К онлайн-репозиторию стандартных операционных процедур (СОП) для (мета)геномной аннотации. OMICS 12 , 137–141 (2008).
КАС Статья Google ученый
Hatcher, E. L. et al. Ресурс вариаций вируса — улучшенный ответ на возникающие вирусные вспышки. Рез. нуклеиновых кислот. 45 , Д482–Д490 (2017).
КАС Статья Google ученый
Татусова Т. и др. Конвейер аннотации прокариотического генома NCBI. Рез. нуклеиновых кислот. 44 , 6614–6624 (2016).
КАС Статья Google ученый
Кирс, М. и др. Geneious basic: интегрированная и расширяемая настольная программная платформа для организации и анализа данных о последовательностях. Биоинформатика 28 , 1647–1649 (2012).
Артикул Google ученый
«>
Koehler, J.W. et al. Разработка и оценка панели зондов для захвата последовательности филовирусов для обнаружения патогенов с помощью секвенирования следующего поколения. PLoS One 9 , e107007 (2014 г.).
ОБЪЯВЛЕНИЕ Статья Google ученый
Скачать ссылки
Благодарности
Этот проект финансируется за счет федеральных средств Управления по борьбе с терроризмом и новыми угрозами, Управления по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов, Министерства здравоохранения и социальных служб по контракту № HHSF223201310109C, HHSF223201510106C, HHSF223201610073C и Министерством обороны по контракту № 224-15-6506R. Это исследование было поддержано Программой внутренних исследований NIH, Национальной медицинской библиотеки. Этот проект финансировался DTRA, Контракт № CB10245. Авторы хотели бы поблагодарить доктора Салли Хойват и доктора Пейтона Хобсона за полезные обсуждения. Образцы вкладов для первоначального набора из 500 от Медицинского научно-исследовательского института инфекционных заболеваний армии США, Программы критических реагентов Министерства обороны, Агентства общественного здравоохранения Канады, Общественного здравоохранения Англии, Медицинского отделения Техасского университета, Центра по контролю за заболеваниями Британской Колумбии, США Коллекция типовых культур, Рокфеллеровский университет, FDA-CBER (Мария Риос, Роберт Дункан, Рафаэль Гужмао), FDA-CFSAN (Эрик Браун, Марк Аллард, Мария Хоффман, Кэри Пироне), FDA-CVM (Патрик МакДермотт, Шаохуа Чжао), Детский Национальная больница (Джозеф Кампос, Бриттани Голдберг, Челси Гейер), Медицинская школа Университета Колорадо (Томас Моррисон, Судхакар Агнихотрам). Мнения, толкования, выводы и рекомендации, содержащиеся в данном документе, принадлежат авторам и не обязательно одобрены армией США. Высказанные здесь взгляды принадлежат авторам и не обязательно отражают точку зрения или официальную позицию FDA, NIH или DOE.
Author information
Authors and Affiliations
U.S. Food and Drug Administration, 10903 New Hampshire Ave, Silver Spring, MD, 20993, USA
Heike Sichtig, Yi Yan, Stephen Lovell & Uwe Scherf
U.S. Армейский медицинский научно-исследовательский институт инфекционных заболеваний, 1425 Porter Street, Frederick, MD, 21702, США
Тимоти Миноуг, Кристофер Стефан, Эдриенн Холл, Джеффри Келер и Рэндал Шопп
Институт геномных наук Университета Мэриленда, 670 W. Baltimore Street, Baltimore, MD, 21201, USA
Люк Таллон, Лиза Садзевич и Суварна Надендла
Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека , 8600 Rockville Pike, Bethesda, MD, 20894, USA
William Klimke, Eneida Hatcher & Martin Shumway
Lawrence Livermore National Laboratory, P.O. Box 808, Ливермор, Калифорния, 94551, USA
Dayanara Lebron Aldea, Jonathan Allen & Tom Slezak
Авторы
Heike Sichtig
Просмотр публикаций автора
Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Scholar
Тимоти Миноуг
Просмотр публикаций автора
Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Scholar
Yi Yan
Посмотреть публикации автора
Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Scholar
Christopher Stefan
Просмотр публикаций автора
Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Scholar
Adrienne Hall
Просмотр публикаций автора
Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Scholar
Luke Tallon
Просмотр публикаций автора
Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Академия
Лиза Садзевич
Посмотреть публикации автора
Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Scholar
Suvarna Nadendla
Просмотр публикаций автора
Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Scholar
William Klimke
Посмотреть публикации автора
Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Scholar
Энеида Хэтчер
Посмотреть публикации автора
Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Scholar
Martin Shumway
Просмотр публикаций автора
Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Scholar
Dayanara Lebron Aldea
Посмотреть публикации автора
Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Scholar
Джонатан Аллен
Просмотр публикаций автора
Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Scholar
Jeffrey Koehler
Просмотр публикаций автора
Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Scholar
Tom Slezak
Просмотр публикаций автора
Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Scholar
Стивен Ловелл
Просмотр публикаций автора
Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Scholar
Randal Schoepp
Просмотр публикаций автора
Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Scholar
Uwe Scherf
Просмотр публикаций автора
Вы также можете искать этого автора в PubMed Google Scholar
Взносы
Х. С. задумал проект, руководил проектом, собирал образцы, регистрировал образцы, писал и редактировал документ, создавал рисунки, таблицы и данные, выполнял анализ данных и выступал в качестве главного исследователя. Т.Д.М. руководил координацией вариантов использования, а также написал и отредактировал документ. Ю.Ю. занимался разработкой сценариев/команд, анализом данных, собирал и систематизировал показатели базы данных FDA-ARGOS. C.S собирал и выделял образцы, извлекал ДНК, выполнял подготовку библиотеки и секвенирование Illumina, собирал и систематизировал данные для Исследование пробелов E. avium , а также сгенерированные и пересмотренные цифры. AH выполнил извлечение ДНК, подготовку библиотеки, секвенирование MIPS и Illumina, а также собрал и систематизировал данные для исследования Эболы in silico. Л.Т. работало ли секвенирование IGS. Л.С. работало ли секвенирование IGS. С.Н. провел анализ данных и собрал, зарегистрировал в NCBI и организовал данные из работы по секвенированию IGS. В.К. и М.С. помог с координацией BioProject и представления данных и бактериальных аннотаций и оценки для заполнения пробелов. Э.Х. делал вирусные аннотации. Д.Л. сделал LMAT-анализ. Дж.А. координированный анализ LMAT. Дж.К. собранные и секвенированные образцы. Т.С. помог разработать исследование и план эксперимента. С.Л. помог разработать исследование и план эксперимента. Р.С. собраны клинические образцы. США помогли разработать исследование и план эксперимента.
Авторы переписки
Переписка с Хайке Зихтиг или Тимоти Миноуг.
Заявление об этике
Конкурирующие интересы
Авторы не заявляют об отсутствии конкурирующих интересов.
Дополнительная информация
Информация для рецензирования: Nature Communications благодарит анонимных рецензентов за их вклад в рецензирование этой работы. Доступны отчеты рецензентов.
Примечание издателя: Springer Nature остается нейтральной в отношении юрисдикционных претензий в опубликованных картах и институциональной принадлежности.
Supplementary information
Supplementary Information
Supplementary Data 1
Supplementary Data 2
Supplementary Data 3
Supplementary Data 4
Supplementary Data 5
Supplementary Data 6
Supplementary Data 7
Supplementary Data 8
Supplementary Data 9
Reporting Summary
Description of Additional Supplementary Files
Peer Review File
Rights and permissions
Открытый доступ Эта статья находится под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 International License, которая разрешает использование, совместное использование, адаптацию, распространение и воспроизведение на любом носителе или в любом формате при условии, что вы укажете автора(ов) оригинала и источник, предоставьте ссылку на лицензию Creative Commons и укажите, были ли внесены изменения. Изображения или другие сторонние материалы в этой статье включены в лицензию Creative Commons для статьи, если иное не указано в кредитной строке материала. Если материал не включен в лицензию Creative Commons статьи, а ваше предполагаемое использование не разрешено законом или выходит за рамки разрешенного использования, вам необходимо получить разрешение непосредственно от правообладателя. Чтобы просмотреть копию этой лицензии, посетите http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/.
Перепечатка и разрешения
Об этой статье
Дополнительная литература
VIM-кодирующие плазмиды IncpSTY и хромосомные интегративные и мобилизуемые элементы (IME) и интегративные и конъюгативные элементы (ICE) у Pseudomonas
Фанчжоу Чен
Пэн Ван
Дуншэн Чжоу
Анналы клинической микробиологии и противомикробных препаратов (2022)
Выращивание биопленки способствует сосуществованию и адаптивной эволюции в промышленном бактериальном сообществе.
Натали Н. С. Э. Хенриксен
Мэдс Фредерик Хансен
Метте Бурмолле
npj Биопленки и микробиомы (2022)
SAUTE: сборка последовательности с использованием целевого обогащения
Александр Суворов
Рича Агарвала
Биоинформатика BMC (2021)
Прекращение заражения: крупномасштабный поиск идентифицирует более 2 000 000 зараженных записей в GenBank
Мартин Штайнеггер
Стивен Л.
No related posts.

Аргос это: Аргос, Пелопоннес — Путеводитель | Grekomania

ООО «АРГОС» — бурение и сервисные услуги для нефтегазовой отрасли

Компания сегодня

Стратегия компании

Наши заказчики

10 лучших отелей в городе Аргос, Греция (от € 50)

Количество звезд

Оценка по отзывам

Morfeas Hotel

Apollon Hotel

Palladion Boutique Hotel

Hotel Mycenae

Central flat in Argos with a view on Nafplio

Paraskevi’s House

Urban comfortable apartment

ΘΕΑ στο ΝΑΥΠΛΙΟ

Arcadia Spirit

Villa Ero

Аргос и аргосская коалиция в период Никиева мира Текст научной статьи по специальности «История и археология»

Greece Guideline > Памятные места > Древняя агора Аргоса

Argos | Ловел — промышленное оборудование

Светодиодные Cветильники «Аргос-Трейд»-Санкт-Петербург

Сообщество | Аргос Научный | Global

КАЛИФОРНИЯ

БЛИЖНИЙ ВОСТОК

СРЕДНИЙ ЗАПАД

ЮЖНАЯ АФРИКА

Как работает система Argos и как собираются данные Argos?

Передатчики Argos PTT

Спутники

Спутники находятся на полярной орбите на высоте 850 км

На полюсах спутники видят каждый передатчик при каждом проходе, примерно 14 раз в день на спутник.

Приемные станции

Центры обработки

Все эти результаты сохраняются и предоставляются пользователям Argos.

Часто задаваемые вопросы — UIT

Общий

Должен ли я использовать Argos?

Заменяет ли Argos платформы приложений, такие как Apex и MS Access?

Argos работает через Интернет, безопасно ли это?

Начало работы

Как начать пользоваться Argos?

Какие специальные знания/навыки необходимы для использования Argos?

Доступно ли обучение Argos?

У меня проблемы со входом в iData или Argos, что мне делать?

Что может сделать Аргос?

Могу ли я использовать Argos для составления отчетов по нескольким источникам данных?

Поддерживает ли Argos кубы OLAP?

Как я могу использовать Argos для создания и представления письма?

Есть ли в Argos функция детализации?

Есть ли в Argos встроенный редактор SQL для устранения неполадок?

Университет информационных технологий

Вице-президент по информационным технологиям и информационным технологиям:

Аргос | Злодеи Вики | Fandom

Содержание

Внешний вид

Силы и способности

Общая информация

Навигация

Argos — Студенческие записи — UA Little Rock

Представленные окончательные оценки

Зачисление студентов по отделам

Сведения о учащемся (QV)

Ограничения курса

Основные списки по фильтрам

Основная контактная информация

Проверка степени: использованный курс (QV)

Внесены коррективы (QV)

Список утверждающих (QV)

Изменения курса для учащихся

Общий учащийся (QV)

Эквивалентность перевода

Список деканов

Планирование — Ограничения класса

Планирование — файл CSV-веб-курсы

Планирование — CSV — Список классов

Выпускной

Выпуск минус ONGA

FDA-ARGOS — это база данных с общедоступными эталонными геномами, прошедшими контроль качества, для использования в диагностике и научных исследованиях

Abstract